More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1307 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
573 aa  1145    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  54.04 
 
 
570 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  45.31 
 
 
590 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  46.33 
 
 
417 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.78 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  32.36 
 
 
540 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  27.93 
 
 
689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  34.25 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  30.29 
 
 
507 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.84 
 
 
639 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.71 
 
 
593 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  33.91 
 
 
659 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  32.85 
 
 
662 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  32 
 
 
619 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  32.39 
 
 
661 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  30.8 
 
 
826 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.92 
 
 
585 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.53 
 
 
664 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  33.65 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  32.1 
 
 
649 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.49 
 
 
563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 
636 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.48 
 
 
633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.54 
 
 
645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
472 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.71 
 
 
625 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  34.8 
 
 
608 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.88 
 
 
586 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.88 
 
 
586 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.88 
 
 
586 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  27.26 
 
 
512 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  35.59 
 
 
603 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.85 
 
 
606 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  33.02 
 
 
599 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.71 
 
 
604 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  33.88 
 
 
644 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.85 
 
 
590 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.85 
 
 
606 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  32.63 
 
 
678 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.49 
 
 
588 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 
487 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 
485 aa  90.5  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  28.78 
 
 
643 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.51 
 
 
643 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.97 
 
 
531 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  26.96 
 
 
972 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31.48 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  33.81 
 
 
612 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  25.41 
 
 
610 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.82 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 
481 aa  84  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  25.41 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.72 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.59 
 
 
646 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.91 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.11 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.3 
 
 
647 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 
570 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
643 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  26.65 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
501 aa  77  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.81 
 
 
485 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  24.72 
 
 
649 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  26.91 
 
 
490 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  28.45 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  27.08 
 
 
739 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.41 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  30.14 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.61 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 
577 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 
493 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.91 
 
 
415 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
504 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  25.86 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.05 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  24.51 
 
 
557 aa  70.5  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  28.42 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  29.38 
 
 
630 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.27 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  26.8 
 
 
641 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  25 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.69 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.73 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>