More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3973 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 580 aa  1139    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.58 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.58 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.58 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.99 
 
 		 593 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.46 
 
 		 585 aa  359  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  38.37 
 
 		 599 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  37.33 
 
 		 608 aa  312  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  37.74 
 
 		 603 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.77 
 
 		 606 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.63 
 
 		 604 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.75 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.94 
 
 		 606 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.28 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  36.66 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  35.8 
 
 		 644 aa  267  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  36.52 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  43.26 
 
 		 540 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.95 
 
 		 664 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  30.17 
 
 		 661 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.58 
 
 		 625 aa  180  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.98 
 
 		 507 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.66 
 
 		 543 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.42 
 
 		 619 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.51 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.29 
 
 		 608 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  31.71 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  29.69 
 
 		 662 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.94 
 
 		 636 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  33.96 
 
 		 678 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.12 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  32.3 
 
 		 649 aa  147  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  29.61 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  30.07 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  31.75 
 
 		 570 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.94 
 
 		 643 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.04 
 
 		 512 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  29 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  33.25 
 
 		 826 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.85 
 
 		 643 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.85 
 
 		 689 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.25 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4485  NTF2 domain protein transpeptidase  26.64 
 
 		 559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  30.79 
 
 		 647 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  33.86 
 
 		 573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 472 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 647 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  27.62 
 
 		 648 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.72 
 
 		 645 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 524 aa  109  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 636 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 		 649 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 636 aa  106  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.11 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.5 
 
 		 639 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.04 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.5 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.13 
 
 		 646 aa  104  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.28 
 
 		 487 aa  104  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.54 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 642 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 639 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 		 822 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  32.29 
 
 		 417 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 662 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.73 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 473 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.27 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 551 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 		 643 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 633 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 617 aa  98.2  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  27.92 
 
 		 646 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  29.03 
 
 		 596 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.39 
 
 		 458 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.65 
 
 		 481 aa  97.1  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 482 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 		 660 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 648 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  30.5 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>