More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4076 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  70.48 
 
 		 603 aa  864    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  80.96 
 
 		 590 aa  943    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 604 aa  1221    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  78.71 
 
 		 606 aa  966    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  78.88 
 
 		 606 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  91.48 
 
 		 588 aa  1076    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  49 
 
 		 608 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  46.92 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  41.74 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.5 
 
 		 586 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.5 
 
 		 586 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.5 
 
 		 586 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  36.69 
 
 		 644 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.85 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.24 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  36.9 
 
 		 580 aa  281  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.59 
 
 		 633 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  31.56 
 
 		 619 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  31.43 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 		 625 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 		 659 aa  177  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.46 
 
 		 507 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40 
 
 		 512 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.64 
 
 		 643 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  39.53 
 
 		 540 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  31.78 
 
 		 826 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  34.76 
 
 		 689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.48 
 
 		 689 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.06 
 
 		 643 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  28.75 
 
 		 661 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 636 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  28.9 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.43 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 645 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.26 
 
 		 608 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.48 
 
 		 664 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  30.97 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  26.48 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.54 
 
 		 639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.6 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.31 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  28.32 
 
 		 649 aa  124  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 		 649 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  33.12 
 
 		 570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  34.35 
 
 		 417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 458 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  27.13 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  27.13 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  26.5 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  25.28 
 
 		 648 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 489 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.71 
 
 		 573 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  24.25 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 		 924 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.43 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 624 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  27.37 
 
 		 647 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 		 647 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.98 
 
 		 646 aa  98.2  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  27.49 
 
 		 487 aa  97.1  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  34.05 
 
 		 921 aa  97.1  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  26.95 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 485 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  27.19 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.87 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  29.83 
 
 		 972 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 		 647 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  31.56 
 
 		 933 aa  94.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 628 aa  94.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  27.85 
 
 		 605 aa  94.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.89 
 
 		 559 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.05 
 
 		 822 aa  94  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 643 aa  94  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.66 
 
 		 490 aa  94  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.24 
 
 		 646 aa  94  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  33.44 
 
 		 560 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.45 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 		 636 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 483 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.11 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.53 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.2 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 461 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.7 
 
 		 481 aa  91.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 639 aa  90.9  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 669 aa  90.1  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.09 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 493 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>