More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0053 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
485 aa  989    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.34 
 
 
485 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  46.91 
 
 
485 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  47.76 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  48.28 
 
 
489 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  46.72 
 
 
480 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.1 
 
 
483 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.41 
 
 
487 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
491 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
491 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
491 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.4 
 
 
480 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  43.7 
 
 
489 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.18 
 
 
493 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
489 aa  364  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.13 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.9 
 
 
483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.41 
 
 
491 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.42 
 
 
485 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  43.81 
 
 
482 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 
484 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  43.41 
 
 
491 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.51 
 
 
493 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  40.99 
 
 
504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.22 
 
 
481 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.4 
 
 
501 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.32 
 
 
490 aa  331  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  43.17 
 
 
503 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.25 
 
 
488 aa  329  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  40.6 
 
 
495 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.94 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  39.88 
 
 
490 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 
486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.12 
 
 
488 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 
486 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.71 
 
 
476 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
473 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.93 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.39 
 
 
481 aa  282  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
458 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  37.95 
 
 
488 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  38.98 
 
 
461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
490 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 
470 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 
924 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  35.19 
 
 
492 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.65 
 
 
493 aa  257  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 
573 aa  253  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  38.1 
 
 
489 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  35.52 
 
 
933 aa  247  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  34.29 
 
 
471 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  35.44 
 
 
972 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
472 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 
570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  36.23 
 
 
579 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
584 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 
578 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  33.94 
 
 
921 aa  227  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33.66 
 
 
487 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
487 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 
577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.74 
 
 
640 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 
574 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 
954 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 
610 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  35.25 
 
 
647 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.41 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  36.34 
 
 
641 aa  196  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 
646 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 
643 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
723 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
673 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.49 
 
 
701 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.53 
 
 
646 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 
634 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 
535 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
645 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 
626 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
634 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
672 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
609 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.08 
 
 
615 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
664 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.07 
 
 
639 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
678 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
709 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.55 
 
 
611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 
618 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  34.35 
 
 
700 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
642 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
636 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 
646 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.91 
 
 
695 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
557 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 
647 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 
645 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 
598 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>