More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4002 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  100 
 
 
643 aa  1280    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  40.07 
 
 
630 aa  357  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38 
 
 
643 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  38.46 
 
 
627 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  36.83 
 
 
689 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.15 
 
 
633 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
625 aa  229  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  31.33 
 
 
540 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  33.83 
 
 
619 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  40.21 
 
 
689 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.89 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  35.13 
 
 
678 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  32.92 
 
 
659 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.1 
 
 
507 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.91 
 
 
664 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  28.21 
 
 
661 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.21 
 
 
639 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  29.72 
 
 
599 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 
645 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.28 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  34.08 
 
 
826 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.64 
 
 
604 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.8 
 
 
606 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.87 
 
 
588 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  27.65 
 
 
662 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.8 
 
 
590 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.8 
 
 
606 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  29.51 
 
 
649 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.9 
 
 
563 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  27.23 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.05 
 
 
608 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.36 
 
 
512 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  29.94 
 
 
580 aa  140  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  28.74 
 
 
608 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.85 
 
 
586 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.85 
 
 
586 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.85 
 
 
586 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  33.23 
 
 
644 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.54 
 
 
593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.45 
 
 
531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  35.52 
 
 
612 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.82 
 
 
585 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  30.72 
 
 
417 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  24.73 
 
 
645 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  29.93 
 
 
570 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  24.96 
 
 
647 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  23.52 
 
 
775 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 
643 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 
639 aa  97.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  21.74 
 
 
661 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  24.94 
 
 
640 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  24.45 
 
 
636 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  25.49 
 
 
642 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  20.66 
 
 
642 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  21.57 
 
 
661 aa  94  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  21.39 
 
 
661 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  21.39 
 
 
661 aa  94  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  21.39 
 
 
661 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2022  penicillin-binding protein 3  21.74 
 
 
661 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000411725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  25 
 
 
615 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  21.39 
 
 
661 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  28.3 
 
 
560 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1641  peptidoglycan glycosyltransferase  19.04 
 
 
661 aa  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
483 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.41 
 
 
574 aa  90.9  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  20.58 
 
 
655 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  28.78 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  21.11 
 
 
661 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  22.14 
 
 
640 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  20.84 
 
 
661 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
606 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  20.93 
 
 
661 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  20.72 
 
 
655 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  24.65 
 
 
648 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  26.43 
 
 
708 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  24.45 
 
 
648 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  20.92 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  24.45 
 
 
648 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  26.87 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  23.31 
 
 
691 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.43 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  28.73 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  24.63 
 
 
689 aa  84  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 
609 aa  84  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  22.65 
 
 
617 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  22 
 
 
600 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.05 
 
 
603 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.45 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  23.14 
 
 
728 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
485 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  25.65 
 
 
471 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  24.8 
 
 
721 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  25.18 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  24.43 
 
 
596 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  24.06 
 
 
681 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>