More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0475 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
678 aa  1278    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.11 
 
 
625 aa  362  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.85 
 
 
664 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  44.62 
 
 
633 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  43.11 
 
 
659 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  39.25 
 
 
662 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  43.06 
 
 
619 aa  306  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.34 
 
 
639 aa  290  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.75 
 
 
645 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  40.56 
 
 
649 aa  277  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  37.5 
 
 
661 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.3 
 
 
636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  35.66 
 
 
643 aa  260  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  41.82 
 
 
689 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  43.58 
 
 
540 aa  210  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 
643 aa  210  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  42.54 
 
 
608 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.3 
 
 
563 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  34.24 
 
 
599 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.11 
 
 
543 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  40.1 
 
 
826 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  32.81 
 
 
627 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  32.89 
 
 
630 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.65 
 
 
586 aa  190  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.65 
 
 
586 aa  190  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.65 
 
 
586 aa  190  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.18 
 
 
507 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  33.9 
 
 
580 aa  187  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  32.83 
 
 
689 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  31.16 
 
 
644 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  32.47 
 
 
608 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.81 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  35 
 
 
585 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  31.15 
 
 
603 aa  164  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.44 
 
 
590 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.44 
 
 
606 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.05 
 
 
593 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  29.74 
 
 
612 aa  157  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.39 
 
 
604 aa  154  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.86 
 
 
588 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.3 
 
 
512 aa  134  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  24.08 
 
 
574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 
643 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.74 
 
 
645 aa  127  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 
636 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.41 
 
 
647 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.47 
 
 
473 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  33.99 
 
 
570 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.31 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  31.85 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.94 
 
 
503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  25.74 
 
 
642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  26.94 
 
 
557 aa  112  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  25.5 
 
 
639 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 
535 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 
691 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  24.45 
 
 
640 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  25.36 
 
 
603 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
504 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  26.83 
 
 
557 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  32.8 
 
 
417 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
660 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
470 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  24.43 
 
 
634 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 
472 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  22.34 
 
 
551 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.65 
 
 
524 aa  105  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 
482 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
491 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  24.14 
 
 
727 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
491 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.87 
 
 
491 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
491 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 
597 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  23.72 
 
 
551 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  25.53 
 
 
471 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 
485 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
485 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  25.64 
 
 
647 aa  99.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
485 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  24.63 
 
 
610 aa  99  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.28 
 
 
822 aa  99  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 
678 aa  99  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  23.78 
 
 
727 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  21.43 
 
 
661 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 
633 aa  97.8  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 
478 aa  97.8  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  23.59 
 
 
723 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  20.8 
 
 
661 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  21.26 
 
 
661 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  27.12 
 
 
586 aa  97.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  24 
 
 
582 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  31.63 
 
 
590 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  21.06 
 
 
661 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  21.06 
 
 
661 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  26.89 
 
 
636 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  25.3 
 
 
695 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  23.73 
 
 
625 aa  95.9  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.09 
 
 
476 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>