More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 645 aa  1255    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  50.86 
 
 		 659 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  48.37 
 
 		 649 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  46.44 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.78 
 
 		 664 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  45.47 
 
 		 662 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.44 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.75 
 
 		 636 aa  349  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.12 
 
 		 625 aa  270  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  40.35 
 
 		 633 aa  269  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  38.19 
 
 		 619 aa  261  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  39.03 
 
 		 678 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  37.79 
 
 		 689 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.48 
 
 		 643 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  37.56 
 
 		 826 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.78 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.73 
 
 		 593 aa  173  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.14 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  32.1 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  38.74 
 
 		 540 aa  171  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  31.31 
 
 		 599 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.03 
 
 		 608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.06 
 
 		 563 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  28.99 
 
 		 603 aa  165  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.25 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.25 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.25 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.3 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 643 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  35.2 
 
 		 644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.59 
 
 		 543 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.64 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.8 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 627 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.87 
 
 		 590 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.02 
 
 		 604 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.71 
 
 		 588 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  32.18 
 
 		 689 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.94 
 
 		 531 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  29.12 
 
 		 630 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  35.89 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  28.5 
 
 		 608 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 		 615 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.15 
 
 		 573 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  25.12 
 
 		 574 aa  120  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.13 
 
 		 646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.19 
 
 		 640 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  28.42 
 
 		 612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.29 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  27.07 
 
 		 689 aa  114  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  28.39 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 590 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  26.67 
 
 		 640 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  28.51 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  28.51 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.2 
 
 		 647 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  26.29 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  26.21 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  25.93 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  26.82 
 
 		 972 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 639 aa  105  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.74 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 648 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  34.84 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  24.62 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  26.77 
 
 		 617 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 480 aa  101  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  25.62 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.68 
 
 		 634 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 480 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 482 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.11 
 
 		 643 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 		 481 aa  98.2  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  24.78 
 
 		 691 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  25.56 
 
 		 600 aa  98.2  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.17 
 
 		 619 aa  97.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 482 aa  97.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.65 
 
 		 708 aa  97.4  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 485 aa  97.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.06 
 
 		 645 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  25.68 
 
 		 719 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  25.49 
 
 		 640 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  25.17 
 
 		 608 aa  96.3  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  28.9 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  23.46 
 
 		 775 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.82 
 
 		 547 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  26.86 
 
 		 622 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.82 
 
 		 603 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  24.2 
 
 		 524 aa  95.5  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  24.55 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  24.67 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  24.77 
 
 		 598 aa  95.1  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 		 547 aa  95.1  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>