More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1448 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 570 aa  1142    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  51.79 
 
 		 573 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  46.68 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  50.64 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  31.59 
 
 		 507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  31.41 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  33.54 
 
 		 540 aa  150  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.34 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.34 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.34 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  30.11 
 
 		 689 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.77 
 
 		 664 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  34.87 
 
 		 662 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  38.24 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  35.24 
 
 		 619 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  36.23 
 
 		 659 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  35.38 
 
 		 649 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.5 
 
 		 593 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.83 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.25 
 
 		 639 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  34.71 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.55 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.28 
 
 		 645 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  35.81 
 
 		 603 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.22 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.5 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  31.6 
 
 		 826 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  36.43 
 
 		 633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  34.3 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 636 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.47 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.19 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.19 
 
 		 606 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.12 
 
 		 604 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  33.11 
 
 		 644 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.63 
 
 		 625 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.6 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  34.52 
 
 		 599 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.93 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  35.74 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  33.57 
 
 		 678 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  29.86 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  27.09 
 
 		 560 aa  90.1  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.25 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 485 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.64 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  29.81 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.36 
 
 		 643 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 485 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.17 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 		 610 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.95 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  32.58 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  29.72 
 
 		 933 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  27.76 
 
 		 634 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  27.81 
 
 		 972 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  27.9 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  25.55 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.48 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.87 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  25.81 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  27.96 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  26.65 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.33 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 493 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  26.06 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.21 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.36 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  26.51 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.05 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>