More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0890 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
547 aa  1111    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  46.21 
 
 
533 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  38.72 
 
 
557 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
557 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1422  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
569 aa  289  7e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.38449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  38.65 
 
 
574 aa  263  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35.77 
 
 
586 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.63 
 
 
611 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 
645 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  38.57 
 
 
627 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  37.16 
 
 
640 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 
609 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  38.69 
 
 
625 aa  233  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.48 
 
 
681 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.8 
 
 
626 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  36.34 
 
 
803 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  36.34 
 
 
809 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  36.1 
 
 
803 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  36.34 
 
 
802 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 
701 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
634 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
635 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
610 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
630 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
628 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 
802 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 
802 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 
802 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 
802 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
599 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 
646 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
643 aa  220  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  34.95 
 
 
647 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
635 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  34.92 
 
 
771 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
678 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
602 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.44 
 
 
629 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 
632 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
633 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
767 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
765 aa  217  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 
643 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
662 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 
639 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.09 
 
 
645 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
607 aa  216  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 
629 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
602 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
602 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.54 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  35.52 
 
 
646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 
618 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.29 
 
 
631 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
664 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
636 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 
588 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 
631 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
646 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
631 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 
681 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
637 aa  210  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 
671 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 
647 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.02 
 
 
800 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
630 aa  210  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
673 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.87 
 
 
641 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 
764 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  34.94 
 
 
801 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
691 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
686 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.2 
 
 
775 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 
655 aa  207  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
765 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
765 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  34.68 
 
 
760 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  29.23 
 
 
634 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  34.68 
 
 
756 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 
766 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
761 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  29.59 
 
 
632 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  28.36 
 
 
631 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  30.37 
 
 
638 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  33.02 
 
 
617 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  35.11 
 
 
524 aa  204  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
634 aa  204  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  34.38 
 
 
687 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 
641 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 
793 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
650 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
687 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  32.54 
 
 
617 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
648 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 
634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  31.98 
 
 
600 aa  200  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  28.93 
 
 
634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>