More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3720 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 689 aa  1367    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  52.9 
 
 		 643 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  37.35 
 
 		 643 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  35.43 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  36.87 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  36.19 
 
 		 619 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  32.51 
 
 		 633 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 		 625 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.05 
 
 		 606 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  30.3 
 
 		 603 aa  187  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.89 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.89 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  33.14 
 
 		 661 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  31.87 
 
 		 649 aa  174  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.23 
 
 		 664 aa  170  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.78 
 
 		 543 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 636 aa  160  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.82 
 
 		 604 aa  160  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  30.48 
 
 		 599 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.59 
 
 		 588 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  30.8 
 
 		 659 aa  157  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  31.35 
 
 		 662 aa  150  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  31.99 
 
 		 689 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  28.26 
 
 		 608 aa  143  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  32.6 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.34 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.34 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.34 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.91 
 
 		 645 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  36.42 
 
 		 540 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  29.04 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.41 
 
 		 647 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.25 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 645 aa  138  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  32.37 
 
 		 826 aa  137  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.79 
 
 		 642 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.09 
 
 		 636 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.51 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.28 
 
 		 608 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  27.16 
 
 		 612 aa  130  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  25.61 
 
 		 640 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.41 
 
 		 593 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.74 
 
 		 639 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  23.37 
 
 		 643 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.14 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  21.25 
 
 		 655 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.67 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  25.76 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  25.76 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  20.9 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  20.9 
 
 		 655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25.77 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 605 aa  111  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 660 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  26.28 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 		 689 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  20.04 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.26 
 
 		 619 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  25.89 
 
 		 615 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  26.1 
 
 		 662 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.82 
 
 		 512 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  21.33 
 
 		 661 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  21.6 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1641  peptidoglycan glycosyltransferase  21.9 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  27.93 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0443  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.35 
 
 		 673 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  30.41 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  21.43 
 
 		 661 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 634 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 		 636 aa  100  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  27.43 
 
 		 646 aa  100  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  20.82 
 
 		 661 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  20.82 
 
 		 661 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  20.82 
 
 		 661 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  26.17 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  21.43 
 
 		 661 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.82 
 
 		 640 aa  98.2  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.94 
 
 		 531 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 		 603 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  25.32 
 
 		 597 aa  97.4  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  24.9 
 
 		 681 aa  97.8  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 		 490 aa  97.4  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.56 
 
 		 489 aa  97.4  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2022  penicillin-binding protein 3  20.92 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000411725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 		 570 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  32.29 
 
 		 644 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  29.4 
 
 		 560 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  26.63 
 
 		 681 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  23.82 
 
 		 600 aa  95.5  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  21.09 
 
 		 661 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  21.09 
 
 		 661 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  24.63 
 
 		 628 aa  95.1  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  25.16 
 
 		 596 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.38 
 
 		 822 aa  94.7  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  23.73 
 
 		 775 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  25.95 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  21.85 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>