More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0050 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  54.03 
 
 
548 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  57.92 
 
 
609 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  87.33 
 
 
615 aa  1031    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
595 aa  1212    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  58.6 
 
 
609 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  51.78 
 
 
596 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  59.86 
 
 
602 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  77.55 
 
 
600 aa  910    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  51.65 
 
 
548 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  52.93 
 
 
548 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  45.13 
 
 
605 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  43.8 
 
 
612 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  43.8 
 
 
612 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  40.92 
 
 
600 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  42.71 
 
 
613 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  44.72 
 
 
596 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  40.51 
 
 
610 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 
597 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 
603 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 
639 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
640 aa  295  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.83 
 
 
636 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 
586 aa  287  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
650 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
645 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.21 
 
 
681 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
643 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 
662 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
611 aa  278  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 
610 aa  277  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.22 
 
 
801 aa  276  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.86 
 
 
646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
664 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 
655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
703 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
647 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.22 
 
 
615 aa  273  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
673 aa  273  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.8 
 
 
574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
636 aa  271  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  32.09 
 
 
646 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
793 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 
647 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
642 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.8 
 
 
775 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
671 aa  267  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.43 
 
 
771 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
646 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  32.6 
 
 
646 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 
756 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
803 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.48 
 
 
809 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  32.8 
 
 
760 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
765 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  32.96 
 
 
764 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
765 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
766 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
767 aa  264  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  32.32 
 
 
803 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 
641 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
761 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
802 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
802 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
802 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
802 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 
801 aa  261  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
631 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.85 
 
 
800 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 
801 aa  260  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 
643 aa  260  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
802 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.03 
 
 
619 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 
634 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 
681 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
691 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 
640 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 
678 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
633 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 
588 aa  257  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
646 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
683 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 
629 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
609 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.24 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
631 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
607 aa  254  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
618 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
655 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 
661 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
631 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.24 
 
 
629 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 
640 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 
629 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  29.34 
 
 
679 aa  250  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
637 aa  249  8e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  32.19 
 
 
629 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>