More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0041 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  79.89 
 
 
548 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  56.03 
 
 
609 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  89.21 
 
 
548 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  56.2 
 
 
609 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  51.62 
 
 
615 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  51.78 
 
 
595 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  54.31 
 
 
600 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  100 
 
 
596 aa  1215    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  56.16 
 
 
602 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  89.21 
 
 
548 aa  1015    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  39.76 
 
 
610 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  40.11 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  38.3 
 
 
600 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  38.99 
 
 
605 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  37.77 
 
 
613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 
612 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 
612 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 
597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 
603 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
662 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
610 aa  299  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
664 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
643 aa  297  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.41 
 
 
647 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
646 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35 
 
 
586 aa  290  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 
640 aa  289  8e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 
645 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
643 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
650 aa  286  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
678 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 
647 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 
636 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
630 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
703 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 
673 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
641 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
648 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
642 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.67 
 
 
646 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
766 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 
629 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 
679 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
646 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
633 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 
609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 
629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
631 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 
793 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
645 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 
655 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
800 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.24 
 
 
771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 
671 aa  267  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 
629 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.27 
 
 
646 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 
629 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 
574 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 
767 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 
632 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
631 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 
630 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 
637 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
634 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.32 
 
 
801 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
646 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 
646 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.71 
 
 
631 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 
661 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 
627 aa  263  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 
667 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  32.33 
 
 
588 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 
756 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  29.81 
 
 
803 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 
803 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32 
 
 
619 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 
643 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  29.81 
 
 
809 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 
802 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
640 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 
802 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
617 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 
617 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 
802 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 
802 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 
802 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
618 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 
775 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  31.64 
 
 
625 aa  257  5e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
640 aa  257  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
760 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1162  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153827  normal  0.425668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 
764 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 
634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>