More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1162 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  60.27 
 
 
605 aa  686    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1162  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
585 aa  1185    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153827  normal  0.425668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
646 aa  273  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
671 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 
646 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 
678 aa  263  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 
609 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
605 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
643 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
664 aa  249  7e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.23 
 
 
574 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  32.17 
 
 
596 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 
627 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
662 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 
634 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 
631 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.24 
 
 
629 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.68 
 
 
640 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
586 aa  243  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  32.64 
 
 
548 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
618 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  31.95 
 
 
602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 
613 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
636 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.35 
 
 
646 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  31.7 
 
 
548 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 
646 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
612 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
612 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
633 aa  237  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.26 
 
 
639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.61 
 
 
645 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 
647 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
679 aa  237  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.71 
 
 
629 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.8 
 
 
631 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 
600 aa  235  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 
646 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 
629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  31.42 
 
 
609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 
596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 
629 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  31.59 
 
 
609 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.84 
 
 
619 aa  233  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 
603 aa  233  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 
642 aa  233  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
626 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
610 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 
607 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 
630 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  31.06 
 
 
548 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.43 
 
 
617 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 
673 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
619 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
691 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.99 
 
 
802 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 
610 aa  225  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 
755 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 
640 aa  224  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 
600 aa  223  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.06 
 
 
803 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 
618 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  33.39 
 
 
600 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 
618 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
618 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
618 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.06 
 
 
809 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
618 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 
766 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 
803 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 
610 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
683 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 
631 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 
667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 
655 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 
703 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
643 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 
641 aa  220  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 
640 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
645 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 
630 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 
629 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.03 
 
 
638 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 
597 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
793 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.63 
 
 
658 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
802 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
802 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
641 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
802 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 
802 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
629 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 
655 aa  217  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  28.81 
 
 
617 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 
630 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
602 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>