More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3971 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 633 aa  1225    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.09 
 
 		 625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  42.69 
 
 		 678 aa  306  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  37.54 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  34.55 
 
 		 603 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  35.34 
 
 		 608 aa  279  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  36.26 
 
 		 644 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  37.56 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.79 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  37 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  37 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  37 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  38.99 
 
 		 659 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.79 
 
 		 606 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.35 
 
 		 645 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.3 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.15 
 
 		 604 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  33.49 
 
 		 643 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.18 
 
 		 664 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  34.08 
 
 		 661 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  34.15 
 
 		 662 aa  249  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.57 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  36.52 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  32.1 
 
 		 612 aa  224  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 643 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.04 
 
 		 593 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  37.32 
 
 		 649 aa  220  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  33.11 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.2 
 
 		 585 aa  218  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.12 
 
 		 636 aa  216  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  32.62 
 
 		 689 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  41.59 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.64 
 
 		 639 aa  210  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 627 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  38.08 
 
 		 608 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.06 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  38.32 
 
 		 826 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  38.48 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.89 
 
 		 543 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.84 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.41 
 
 		 512 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.38 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.34 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  36.43 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.4 
 
 		 640 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 		 662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.48 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  25.78 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 822 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  26.07 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2498  penicillin-binding protein 3  24.41 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.992618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 		 458 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 		 643 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.31 
 
 		 639 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2268  penicillin-binding protein  25.19 
 
 		 661 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 		 609 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  24.59 
 
 		 655 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.59 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2350  penicillin-binding protein 3  25 
 
 		 661 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000528095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  25.65 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  25.65 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2022  penicillin-binding protein 3  25 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000411725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2238  penicillin-binding protein 3  25.65 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000023716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  25.63 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  25.78 
 
 		 775 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.73 
 
 		 574 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3103  penicillin-binding protein 3  25.19 
 
 		 661 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0111919  hitchhiker  0.000000000000561272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.22 
 
 		 615 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2265  penicillin-binding protein 3  25.66 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4105599999999994e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2221  penicillin-binding protein 3  25.18 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00242094  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 		 490 aa  106  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  25.78 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  26.61 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2063  peptidoglycan glycosyltransferase  24.63 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00114706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  30.95 
 
 		 560 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  37.05 
 
 		 482 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  24.6 
 
 		 648 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  24.6 
 
 		 648 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  23.37 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  24.86 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  22.99 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.22 
 
 		 634 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  26.68 
 
 		 524 aa  102  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 647 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  25.75 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2321  penicillin-binding protein transpeptidase  24.3 
 
 		 642 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011268  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  28.06 
 
 		 663 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  24.47 
 
 		 607 aa  98.6  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 		 632 aa  99  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  28.19 
 
 		 619 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  25.49 
 
 		 633 aa  97.8  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25.05 
 
 		 648 aa  97.8  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.55 
 
 		 640 aa  97.4  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.98 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1162  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.48 
 
 		 585 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153827  normal  0.425668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1641  peptidoglycan glycosyltransferase  24.08 
 
 		 661 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  26.08 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>