More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2121 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 608 aa  1225    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  48.48 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.34 
 
 		 606 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.15 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.92 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.17 
 
 		 606 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.8 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  45.41 
 
 		 612 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  39.19 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.27 
 
 		 586 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.27 
 
 		 586 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.27 
 
 		 586 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  35.11 
 
 		 644 aa  300  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  38.16 
 
 		 580 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.71 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.45 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.82 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  32.68 
 
 		 619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  33.26 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 		 625 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  29.89 
 
 		 543 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.58 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  31.4 
 
 		 678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.89 
 
 		 664 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  30.15 
 
 		 659 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.58 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.08 
 
 		 643 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  28.18 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.62 
 
 		 608 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  25.57 
 
 		 540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.99 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.35 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  26.49 
 
 		 636 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  28 
 
 		 662 aa  134  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.37 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.57 
 
 		 531 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  28.74 
 
 		 643 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  28.89 
 
 		 826 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  27.51 
 
 		 661 aa  120  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 473 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.31 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.3 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.79 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  31.43 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  25.39 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  34.75 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.8 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  25.72 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.49 
 
 		 972 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.82 
 
 		 574 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  27.37 
 
 		 649 aa  107  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.91 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 489 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.03 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 		 547 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.28 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 		 490 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  27.93 
 
 		 470 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.14 
 
 		 645 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 647 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  22.5 
 
 		 636 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.2 
 
 		 643 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  21.39 
 
 		 586 aa  97.8  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  24.72 
 
 		 630 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  24.44 
 
 		 643 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2533  penicillin-binding protein  20.19 
 
 		 655 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0143777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.96 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  25.25 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  24.79 
 
 		 595 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 647 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  24.95 
 
 		 631 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  33.98 
 
 		 590 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  25.54 
 
 		 600 aa  94  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 670 aa  94  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  24.95 
 
 		 631 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  20.9 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.17 
 
 		 636 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.97 
 
 		 646 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.54 
 
 		 642 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 		 602 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  23.33 
 
 		 681 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.8 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  23.44 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 648 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>