More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1011 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 551 aa  1110    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  49.36 
 
 		 551 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.62 
 
 		 559 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 566 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 568 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.07 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.2 
 
 		 708 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.16 
 
 		 740 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.38 
 
 		 695 aa  226  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  32.12 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.61 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  31.24 
 
 		 644 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.17 
 
 		 646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 645 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 		 647 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 549 aa  216  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 		 610 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.59 
 
 		 711 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 		 640 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 704 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.38 
 
 		 639 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2480  penicillin-binding protein transpeptidase  28.05 
 
 		 592 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  31.18 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.82 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 		 643 aa  203  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 705 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 		 643 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 678 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 		 646 aa  201  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 638 aa  200  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  30.4 
 
 		 708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.06 
 
 		 638 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.26 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  26.41 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.72 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 		 635 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 		 664 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 611 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  27.46 
 
 		 663 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.46 
 
 		 656 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.7 
 
 		 642 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 		 662 aa  189  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 636 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.33 
 
 		 634 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.29 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.81 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.43 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.88 
 
 		 682 aa  187  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 557 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 723 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  27.58 
 
 		 645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.68 
 
 		 775 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.39 
 
 		 618 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0973  penicillin-binding protein transpeptidase  28.8 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  26.79 
 
 		 635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 		 822 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  28.16 
 
 		 801 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 729 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  27.52 
 
 		 793 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 		 600 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 		 766 aa  180  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  28.98 
 
 		 645 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.18 
 
 		 647 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  31.06 
 
 		 728 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.06 
 
 		 721 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 		 610 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 		 628 aa  177  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  27.15 
 
 		 615 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 		 629 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  31.5 
 
 		 524 aa  176  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 		 600 aa  176  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  27.11 
 
 		 629 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  27.52 
 
 		 801 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  27.52 
 
 		 801 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  27.02 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4511  penicillin-binding protein  27.44 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000549941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4458  penicillin-binding protein  27.62 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.54 
 
 		 657 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4111  penicillin-binding protein  27.12 
 
 		 584 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.24 
 
 		 646 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 		 640 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 		 629 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4606  penicillin-binding protein  27.45 
 
 		 584 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>