More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1089 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  67.16 
 
 
563 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
608 aa  1192    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  39.92 
 
 
689 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  42.13 
 
 
507 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  46.65 
 
 
619 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  41.27 
 
 
540 aa  243  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  36.14 
 
 
826 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.36 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.34 
 
 
512 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  40.48 
 
 
649 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  38.08 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.29 
 
 
664 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  41.69 
 
 
678 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  37.7 
 
 
662 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  38.55 
 
 
659 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  37.57 
 
 
661 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  43.69 
 
 
599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.35 
 
 
639 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.34 
 
 
636 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.03 
 
 
645 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.79 
 
 
531 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.13 
 
 
625 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.24 
 
 
586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.24 
 
 
586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.24 
 
 
586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.81 
 
 
585 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  38.58 
 
 
580 aa  164  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.47 
 
 
593 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.86 
 
 
606 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  37.36 
 
 
644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  33.06 
 
 
643 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  35.56 
 
 
603 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.01 
 
 
590 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.01 
 
 
606 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  37.01 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.25 
 
 
573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  38.86 
 
 
612 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.22 
 
 
588 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.97 
 
 
643 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
480 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
482 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.26 
 
 
604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.48 
 
 
471 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33.92 
 
 
487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  36.28 
 
 
689 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.63 
 
 
487 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  33.11 
 
 
560 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 
485 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  29.76 
 
 
570 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.22 
 
 
646 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.72 
 
 
610 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 
470 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  31.64 
 
 
627 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
535 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
643 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
458 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  34.06 
 
 
417 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  33.24 
 
 
489 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  35.82 
 
 
630 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
489 aa  124  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.81 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
482 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
610 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 
667 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
603 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  33.77 
 
 
590 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
597 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
615 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.14 
 
 
647 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  29.73 
 
 
972 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 
612 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 
612 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.56 
 
 
645 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 
461 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 
600 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.11 
 
 
598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 
504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  31.72 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 
660 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1104  penicillin-binding protein transpeptidase  32.75 
 
 
600 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
484 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  27.32 
 
 
647 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.16 
 
 
681 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 
643 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
483 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 
822 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>