More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0389 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 649 aa  1246    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  51.38 
 
 		 659 aa  498  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  45.43 
 
 		 662 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  49.14 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.03 
 
 		 664 aa  475  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  48.25 
 
 		 661 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  51.45 
 
 		 639 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.55 
 
 		 636 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.08 
 
 		 625 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  37.74 
 
 		 619 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  39.41 
 
 		 678 aa  257  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  37.32 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  40.48 
 
 		 608 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  39.9 
 
 		 689 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.38 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  31.7 
 
 		 689 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.45 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  39.89 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.8 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  38.61 
 
 		 826 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 		 643 aa  160  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.14 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.14 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.14 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  32.3 
 
 		 580 aa  158  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  27.18 
 
 		 603 aa  157  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  29.4 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.31 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  30.51 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  37.86 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.63 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.99 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.99 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 627 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.99 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.11 
 
 		 604 aa  142  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.72 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  36.28 
 
 		 570 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  27.24 
 
 		 610 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.73 
 
 		 647 aa  124  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.28 
 
 		 646 aa  124  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  26.53 
 
 		 608 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  29.48 
 
 		 630 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  28.37 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.13 
 
 		 643 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  31.8 
 
 		 573 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  27.07 
 
 		 640 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.54 
 
 		 586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  27.39 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.77 
 
 		 487 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.22 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.26 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.77 
 
 		 639 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  35.03 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  23.36 
 
 		 601 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  23.19 
 
 		 599 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.22 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  26.59 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  36.39 
 
 		 531 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  23.06 
 
 		 727 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 634 aa  107  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  25.3 
 
 		 723 aa  107  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  23.72 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  23.06 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 		 605 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  34.36 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 485 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  26.84 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  31.17 
 
 		 489 aa  104  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 606 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 		 634 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  25.06 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 647 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  23.45 
 
 		 608 aa  100  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 660 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  25.45 
 
 		 646 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  25.52 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2521  penicillin-binding protein 2'  21.43 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00245242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  25.35 
 
 		 622 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  25.25 
 
 		 600 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  21.43 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0029  peptidoglycan glycosyltransferase  21.43 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  26.35 
 
 		 636 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  24.84 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.37 
 
 		 476 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  24.87 
 
 		 619 aa  98.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 478 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  26.1 
 
 		 610 aa  97.8  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 482 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>