More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 636 aa  1234    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  37.73 
 
 		 662 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.2 
 
 		 664 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  41.28 
 
 		 659 aa  350  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.75 
 
 		 645 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  37.48 
 
 		 661 aa  332  9e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  41.79 
 
 		 649 aa  329  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.58 
 
 		 639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 625 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  35.26 
 
 		 619 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  34.25 
 
 		 678 aa  223  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.12 
 
 		 633 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  35.08 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.42 
 
 		 593 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  36.19 
 
 		 540 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.9 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.79 
 
 		 543 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.95 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 		 643 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  34.34 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  29.21 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  28.45 
 
 		 643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.54 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.69 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.69 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.69 
 
 		 606 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.15 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.15 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.15 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  30.63 
 
 		 689 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  35.94 
 
 		 580 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.68 
 
 		 588 aa  154  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  28.67 
 
 		 599 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.97 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  31.04 
 
 		 826 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  28.31 
 
 		 627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  33.43 
 
 		 644 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  26.49 
 
 		 608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.74 
 
 		 512 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  33.44 
 
 		 417 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  26.99 
 
 		 597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.94 
 
 		 646 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.87 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.21 
 
 		 615 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  29.25 
 
 		 573 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  31.53 
 
 		 570 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  25.09 
 
 		 622 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.61 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  25.14 
 
 		 647 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  29.07 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.4 
 
 		 645 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  28.34 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  28.34 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  26.79 
 
 		 636 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  27.31 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  25.78 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  28.11 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  24.91 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.63 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  23.84 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.72 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 458 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  27.04 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  28.17 
 
 		 612 aa  105  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  26.75 
 
 		 487 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  25.88 
 
 		 640 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.23 
 
 		 574 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  26.74 
 
 		 605 aa  103  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  24.27 
 
 		 648 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  24.24 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  25.85 
 
 		 619 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.82 
 
 		 702 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  24.64 
 
 		 755 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  24.56 
 
 		 640 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.44 
 
 		 640 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  27.06 
 
 		 473 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 		 472 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 		 727 aa  98.2  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.55 
 
 		 478 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  23 
 
 		 625 aa  97.1  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  23.35 
 
 		 648 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  26.67 
 
 		 600 aa  96.3  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  29.47 
 
 		 590 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.75 
 
 		 635 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  26.29 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.6 
 
 		 481 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  22.64 
 
 		 691 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  24.2 
 
 		 648 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  24.2 
 
 		 648 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.55 
 
 		 642 aa  94.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  24.79 
 
 		 771 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  23.36 
 
 		 619 aa  94.4  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  24.61 
 
 		 802 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  24.61 
 
 		 802 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  24.61 
 
 		 802 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  24.61 
 
 		 802 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>