More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4043 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4159  penicillin-binding protein transpeptidase  95.68 
 
 
417 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4186  penicillin-binding protein transpeptidase  95.68 
 
 
417 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4043  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
415 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0386  penicillin-binding protein transpeptidase  64.56 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213828  hitchhiker  0.0005856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2368  penicillin-binding protein transpeptidase  42.78 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0864167  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2458  penicillin-binding protein, putative  41.3 
 
 
337 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0593  penicillin-binding protein transpeptidase  40.71 
 
 
444 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000288758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0637  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.23 
 
 
449 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00435072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0580  penicillin-binding protein transpeptidase  40.41 
 
 
445 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000287741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2778  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.35 
 
 
455 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000140543  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2896  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.99 
 
 
465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2919  penicillin-binding protein transpeptidase  35.69 
 
 
428 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1370  FtsI-like cell division protein  32.27 
 
 
461 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
458 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
480 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.31 
 
 
972 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
535 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.23 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
473 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.41 
 
 
490 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
483 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
480 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
483 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 
636 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
549 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
485 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 
553 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
489 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.04 
 
 
503 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.23 
 
 
476 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
553 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.78 
 
 
647 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  33.23 
 
 
560 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.4 
 
 
491 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.13 
 
 
489 aa  99.8  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
461 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
924 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 
639 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.39 
 
 
645 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.35 
 
 
643 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  27.86 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  28.45 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
654 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 
566 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 
488 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.45 
 
 
487 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  29.12 
 
 
492 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  28.57 
 
 
488 aa  96.7  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
493 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.03 
 
 
660 aa  96.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
485 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 
672 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
486 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  26.11 
 
 
504 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  30.96 
 
 
608 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
485 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 
486 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 
490 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  28.61 
 
 
933 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.14 
 
 
708 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  25.82 
 
 
640 aa  93.2  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.11 
 
 
657 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 
557 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 
642 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.16 
 
 
657 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 
606 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
487 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.49 
 
 
671 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.37 
 
 
657 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  26.61 
 
 
646 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  31.12 
 
 
489 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
490 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  25.59 
 
 
649 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 
702 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  25.86 
 
 
625 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 
615 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  23.31 
 
 
586 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
689 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 
692 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 
493 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.98 
 
 
606 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  27.89 
 
 
711 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.67 
 
 
481 aa  87  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  28.46 
 
 
557 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  31.17 
 
 
570 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  31.71 
 
 
507 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  29.14 
 
 
599 aa  86.3  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.23 
 
 
737 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  24.13 
 
 
728 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>