More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  61.05 
 
 
921 aa  1090    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  100 
 
 
933 aa  1875    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.39 
 
 
924 aa  1152    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.02 
 
 
954 aa  932    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  29.23 
 
 
972 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  42.08 
 
 
493 aa  315  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  42.98 
 
 
468 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  42.09 
 
 
498 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  42.48 
 
 
429 aa  308  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  42.67 
 
 
426 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  41.82 
 
 
470 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  41.82 
 
 
470 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  41.82 
 
 
470 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  39.72 
 
 
563 aa  281  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  40.33 
 
 
470 aa  280  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  41.95 
 
 
441 aa  280  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  38.05 
 
 
469 aa  277  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  41.84 
 
 
463 aa  277  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.77 
 
 
517 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  40.95 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  41.49 
 
 
473 aa  269  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  39.75 
 
 
529 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  43.01 
 
 
457 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.45 
 
 
485 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  38.89 
 
 
486 aa  266  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.1 
 
 
439 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  40.32 
 
 
496 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  36.83 
 
 
462 aa  265  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  37.92 
 
 
489 aa  264  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  40.77 
 
 
470 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 
470 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  40.37 
 
 
476 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  40.95 
 
 
459 aa  263  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  38.93 
 
 
533 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.71 
 
 
481 aa  260  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  41.34 
 
 
487 aa  260  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  38.26 
 
 
472 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 
504 aa  258  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  39.21 
 
 
463 aa  258  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.35 
 
 
543 aa  257  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  39.47 
 
 
405 aa  256  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  43.88 
 
 
444 aa  255  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  37.31 
 
 
480 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  36.92 
 
 
496 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 
458 aa  253  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  37.73 
 
 
487 aa  248  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 
461 aa  247  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
485 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  37.7 
 
 
469 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  38.82 
 
 
472 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  39.24 
 
 
443 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  38.46 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  40.16 
 
 
480 aa  245  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  39.5 
 
 
428 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 
482 aa  244  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  39.02 
 
 
474 aa  243  9e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 
480 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.66 
 
 
483 aa  242  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  40.61 
 
 
443 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 
485 aa  241  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  38.66 
 
 
459 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  35.54 
 
 
519 aa  239  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  41.28 
 
 
475 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37.17 
 
 
493 aa  239  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
503 aa  238  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  35.19 
 
 
517 aa  238  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  38 
 
 
435 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  38.75 
 
 
409 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
489 aa  232  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 
473 aa  231  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  38.75 
 
 
409 aa  231  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  34.77 
 
 
414 aa  230  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 
485 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.19 
 
 
487 aa  227  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.19 
 
 
487 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 
482 aa  225  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.89 
 
 
483 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
493 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 
486 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  37.16 
 
 
399 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  35.23 
 
 
488 aa  221  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  36.3 
 
 
463 aa  221  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  41.49 
 
 
494 aa  221  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.8 
 
 
471 aa  220  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
493 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  34.1 
 
 
422 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.18 
 
 
490 aa  218  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
478 aa  218  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.84 
 
 
489 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  32.25 
 
 
659 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 
484 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  39.73 
 
 
481 aa  214  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  36.31 
 
 
422 aa  210  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
547 aa  207  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
487 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
490 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
573 aa  205  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 
481 aa  204  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.67 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>