More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1344 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  50.27 
 
 		 921 aa  874    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.73 
 
 		 924 aa  919    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 954 aa  1913    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  54.02 
 
 		 933 aa  930    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.05 
 
 		 972 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  45.53 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  43.46 
 
 		 429 aa  320  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  45.55 
 
 		 441 aa  317  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  40.85 
 
 		 493 aa  313  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  40.85 
 
 		 498 aa  310  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  39.81 
 
 		 468 aa  300  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  40.15 
 
 		 496 aa  295  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  38.77 
 
 		 470 aa  292  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  41.25 
 
 		 470 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  41.25 
 
 		 470 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  41.25 
 
 		 470 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  41.49 
 
 		 462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  38.44 
 
 		 496 aa  286  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  42.59 
 
 		 486 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  38.01 
 
 		 469 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  39.44 
 
 		 533 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  39.42 
 
 		 473 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.1 
 
 		 517 aa  274  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  39.35 
 
 		 529 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  40.22 
 
 		 476 aa  273  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  40.33 
 
 		 463 aa  272  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  42.51 
 
 		 457 aa  271  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  42.16 
 
 		 474 aa  271  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  37.94 
 
 		 496 aa  270  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  37.5 
 
 		 487 aa  269  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  39.86 
 
 		 459 aa  269  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  38.27 
 
 		 472 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  40.62 
 
 		 470 aa  268  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  38.58 
 
 		 487 aa  267  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  38.2 
 
 		 460 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  44.02 
 
 		 444 aa  262  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  41.94 
 
 		 443 aa  261  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  40.87 
 
 		 472 aa  260  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  39.74 
 
 		 469 aa  260  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  37.88 
 
 		 459 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  39.85 
 
 		 439 aa  258  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  36.12 
 
 		 543 aa  257  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  41.34 
 
 		 480 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  38.51 
 
 		 475 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  41.62 
 
 		 443 aa  254  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  36.34 
 
 		 563 aa  253  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  38.87 
 
 		 405 aa  249  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  34.89 
 
 		 517 aa  245  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.61 
 
 		 489 aa  243  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  38.48 
 
 		 519 aa  243  9e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37.29 
 
 		 493 aa  243  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  37.89 
 
 		 463 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  36.94 
 
 		 414 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  37.75 
 
 		 428 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  38.58 
 
 		 435 aa  234  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 		 480 aa  233  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.89 
 
 		 504 aa  232  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  35.53 
 
 		 463 aa  230  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  39.28 
 
 		 494 aa  229  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  36.41 
 
 		 409 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 485 aa  228  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 		 473 aa  228  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.15 
 
 		 422 aa  227  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  33.05 
 
 		 659 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  38.95 
 
 		 399 aa  225  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  36.41 
 
 		 422 aa  225  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.14 
 
 		 409 aa  224  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.43 
 
 		 480 aa  224  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 		 458 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 503 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 485 aa  218  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.32 
 
 		 481 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  38.48 
 
 		 481 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 		 478 aa  215  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 482 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 482 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 470 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 486 aa  209  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.85 
 
 		 471 aa  208  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 461 aa  208  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  32.79 
 
 		 488 aa  206  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 483 aa  207  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 547 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 493 aa  203  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.05 
 
 		 490 aa  201  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 		 487 aa  201  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  34.46 
 
 		 493 aa  199  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  34.07 
 
 		 504 aa  197  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.29 
 
 		 487 aa  197  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 493 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 		 486 aa  194  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 		 573 aa  194  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 487 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 570 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  35.86 
 
 		 480 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>