More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3956 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
570 aa  1147    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  87.35 
 
 
584 aa  991    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.81 
 
 
573 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  44.1 
 
 
579 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 
577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
578 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 
547 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
489 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 
485 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 
485 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.33 
 
 
489 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.7 
 
 
476 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.55 
 
 
471 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
482 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.8 
 
 
489 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 
485 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 
493 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.08 
 
 
481 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 
488 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
473 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
461 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
470 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.02 
 
 
972 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
480 aa  210  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
472 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 
478 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
493 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
458 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
483 aa  204  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.96 
 
 
503 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.58 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 
480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
487 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.04 
 
 
921 aa  192  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 
482 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
491 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.88 
 
 
487 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  31.77 
 
 
933 aa  191  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.97 
 
 
491 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
490 aa  190  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31.54 
 
 
488 aa  190  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
484 aa  190  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  32.09 
 
 
488 aa  189  9e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.74 
 
 
487 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
954 aa  187  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 
503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
924 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 
490 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  31.77 
 
 
491 aa  177  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 
501 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  31.03 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 
486 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
481 aa  171  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  30.42 
 
 
504 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.64 
 
 
495 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
490 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
642 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
582 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
636 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.97 
 
 
492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 
636 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
633 aa  156  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 
610 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  27.17 
 
 
586 aa  152  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
639 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 
643 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.15 
 
 
574 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 
647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
603 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.81 
 
 
701 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
629 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.84 
 
 
645 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.79 
 
 
695 aa  144  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.11 
 
 
629 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.87 
 
 
557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  25.59 
 
 
533 aa  141  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
631 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
630 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 
597 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.99 
 
 
631 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 
631 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 
645 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.89 
 
 
629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 
634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 
709 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  30.58 
 
 
711 aa  137  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
629 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  31.08 
 
 
775 aa  137  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  27.77 
 
 
734 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>