More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0810 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  84.73 
 
 
491 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
491 aa  992    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  84.73 
 
 
491 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  79.55 
 
 
491 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  84.73 
 
 
491 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  87.98 
 
 
491 aa  882    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  56.26 
 
 
504 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  53.52 
 
 
495 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  53.85 
 
 
489 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.92 
 
 
493 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  50 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.81 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  48.39 
 
 
485 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  49.08 
 
 
480 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.46 
 
 
480 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.25 
 
 
485 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  46.89 
 
 
489 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.46 
 
 
485 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.27 
 
 
489 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.38 
 
 
493 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.27 
 
 
483 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.82 
 
 
483 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.89 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  44.13 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 
503 aa  349  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  41.15 
 
 
501 aa  346  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.14 
 
 
490 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.32 
 
 
484 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 
487 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  39.88 
 
 
482 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.93 
 
 
490 aa  312  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.76 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.87 
 
 
481 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  37.72 
 
 
488 aa  290  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.14 
 
 
492 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 
486 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.87 
 
 
504 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.45 
 
 
490 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
473 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  34.33 
 
 
489 aa  246  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
458 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.76 
 
 
493 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.25 
 
 
972 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.08 
 
 
471 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
478 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
503 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
470 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
570 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.25 
 
 
487 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  33.19 
 
 
933 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 
578 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
924 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.57 
 
 
476 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.85 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
577 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
584 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
547 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.44 
 
 
921 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 
610 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.58 
 
 
611 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  31.56 
 
 
579 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 
646 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
801 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
535 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
636 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
801 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 
635 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 
635 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
954 aa  153  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 
574 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
628 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
643 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
645 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
793 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.18 
 
 
801 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
766 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.02 
 
 
557 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 
533 aa  146  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
630 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.21 
 
 
631 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 
709 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
664 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
600 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.08 
 
 
681 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
629 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.83 
 
 
629 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 
657 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
642 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 
647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 
557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
632 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
631 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.85 
 
 
629 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>