More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0579 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
578 aa  1137    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  84.26 
 
 
577 aa  969    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.68 
 
 
573 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  37.06 
 
 
579 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 
570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  39.59 
 
 
584 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 
547 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 
473 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 
458 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.86 
 
 
476 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 
485 aa  231  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 
485 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
461 aa  226  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 
470 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 
485 aa  217  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
482 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 
504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.31 
 
 
972 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 
480 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 
485 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
487 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 
574 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.94 
 
 
481 aa  203  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.2 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 
484 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
480 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
491 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
491 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
491 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.33 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  34.86 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
490 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
490 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.12 
 
 
487 aa  193  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.63 
 
 
487 aa  193  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
493 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.57 
 
 
471 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
503 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.48 
 
 
491 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
557 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.65 
 
 
489 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
478 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  34.29 
 
 
488 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
557 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.51 
 
 
491 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.78 
 
 
493 aa  183  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 
586 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 
483 aa  180  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
488 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  36.33 
 
 
491 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  28.6 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  33.33 
 
 
933 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
924 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  33.55 
 
 
488 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 
639 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.56 
 
 
597 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 
482 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 
603 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.19 
 
 
611 aa  170  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.77 
 
 
483 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.97 
 
 
921 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
486 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  31.51 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
655 aa  164  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  31.36 
 
 
504 aa  163  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
609 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
553 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
612 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
612 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 
701 aa  159  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.94 
 
 
586 aa  159  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
640 aa  159  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 
596 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 
495 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.45 
 
 
481 aa  157  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  28.91 
 
 
640 aa  157  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 
610 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
630 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
643 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
709 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 
630 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 
486 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.74 
 
 
647 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 
636 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 
645 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 
566 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 
636 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 
642 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
662 aa  151  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.39 
 
 
647 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 
633 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 
954 aa  150  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
628 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  30.75 
 
 
489 aa  150  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>