More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0023 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 488 aa  993    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  53.55 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  50.2 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  50.2 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  50.2 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.81 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.37 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.78 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  47.84 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  47.97 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  44.75 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  45.6 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  45.6 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.35 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.51 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.33 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.56 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.86 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.81 
 
 		 483 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 		 480 aa  362  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  42.6 
 
 		 489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.84 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.91 
 
 		 490 aa  348  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  41.25 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 		 484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  41.13 
 
 		 488 aa  330  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.24 
 
 		 481 aa  329  8e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  39.15 
 
 		 482 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  40.04 
 
 		 503 aa  315  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  40.96 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  40.08 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.43 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.97 
 
 		 490 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  35.19 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 504 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  34.12 
 
 		 489 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.67 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 503 aa  226  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 972 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.59 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.98 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 		 573 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 470 aa  220  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.93 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 547 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.84 
 
 		 933 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 924 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  28.54 
 
 		 921 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 		 577 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.54 
 
 		 579 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 		 639 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 		 643 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 		 647 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.72 
 
 		 611 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 642 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 		 645 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  34.94 
 
 		 629 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  34.7 
 
 		 629 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 636 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 		 610 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 609 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.48 
 
 		 629 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 673 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 631 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 954 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.74 
 
 		 631 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 636 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 		 646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 631 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 		 640 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  29.7 
 
 		 701 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 662 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 633 aa  153  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 597 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 		 630 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 619 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 630 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 640 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 		 626 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.42 
 
 		 664 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>