More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3840 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  84.26 
 
 		 578 aa  943    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 577 aa  1136    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.49 
 
 		 573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  37.72 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.28 
 
 		 547 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 		 473 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.42 
 
 		 476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  37.53 
 
 		 485 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 482 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 485 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 472 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.7 
 
 		 490 aa  200  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 		 574 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.52 
 
 		 972 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  196  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 487 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 		 493 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.15 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.93 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 490 aa  190  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.33 
 
 		 489 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  34.77 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.89 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.53 
 
 		 491 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  34.7 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  30.69 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.11 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 483 aa  181  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 		 586 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 493 aa  180  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 557 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 		 503 aa  177  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  34.87 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 645 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 924 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.75 
 
 		 921 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 639 aa  171  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  32.87 
 
 		 933 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 597 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  31.89 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  32.83 
 
 		 488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 486 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.72 
 
 		 596 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  30.87 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.45 
 
 		 701 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 609 aa  160  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 		 612 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 		 612 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 643 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  27.86 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 636 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 640 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.94 
 
 		 481 aa  158  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 		 647 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 		 645 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 		 640 aa  156  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 655 aa  156  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.42 
 
 		 610 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 553 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 636 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.86 
 
 		 647 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 630 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 642 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 954 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 615 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 559 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 631 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 		 681 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>