More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0025 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  87.98 
 
 
491 aa  882    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  83.5 
 
 
491 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  78.69 
 
 
491 aa  752    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  83.5 
 
 
491 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  83.5 
 
 
491 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
491 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  57.49 
 
 
504 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  52.85 
 
 
489 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  52.73 
 
 
495 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  49.8 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.37 
 
 
488 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  48.89 
 
 
485 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  49.08 
 
 
480 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.83 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.67 
 
 
489 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.83 
 
 
485 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  46.29 
 
 
489 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.84 
 
 
485 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
483 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.6 
 
 
493 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.51 
 
 
483 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  43.41 
 
 
485 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.3 
 
 
481 aa  349  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.85 
 
 
487 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 
490 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  41.27 
 
 
503 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.74 
 
 
490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  39.84 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.36 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  37.72 
 
 
488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.23 
 
 
481 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 
486 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.55 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 
504 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 
490 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.86 
 
 
473 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  33.27 
 
 
489 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 
461 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.13 
 
 
493 aa  229  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.78 
 
 
972 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
472 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.97 
 
 
471 aa  220  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
478 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.59 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 
470 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
573 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  32.08 
 
 
933 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 
924 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
570 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.78 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
577 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
578 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.2 
 
 
487 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 
547 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  32.09 
 
 
921 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 
640 aa  173  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 
611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  32.22 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
954 aa  164  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 
610 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.92 
 
 
646 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
636 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
645 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 
639 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 
642 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 
643 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
547 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
535 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 
649 aa  150  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.97 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 
600 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.21 
 
 
631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.71 
 
 
647 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  32.1 
 
 
586 aa  146  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.69 
 
 
629 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.68 
 
 
619 aa  146  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
629 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 
628 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 
551 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
609 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
631 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.38 
 
 
629 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
657 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 
635 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 
801 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 
636 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.65 
 
 
701 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  33.53 
 
 
615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 
801 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>