More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1175 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 533 aa  1080    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  46.21 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  38.85 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1422  peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 		 569 aa  339  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.38449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  32.98 
 
 		 634 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.51 
 
 		 641 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.51 
 
 		 638 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 637 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 634 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 634 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 		 623 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 623 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 623 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 623 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  31.01 
 
 		 623 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  34.98 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.23 
 
 		 627 aa  253  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 		 641 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 631 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 645 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  28.78 
 
 		 632 aa  246  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 		 629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 701 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 		 629 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 		 611 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 629 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 		 618 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 629 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 617 aa  240  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.49 
 
 		 574 aa  240  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 631 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  30.23 
 
 		 637 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  29.81 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 631 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.48 
 
 		 639 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 643 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.9 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 		 638 aa  230  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 		 642 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 636 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 		 643 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  29.55 
 
 		 652 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 650 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 630 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 618 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 629 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 		 645 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  31.19 
 
 		 686 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 		 646 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 633 aa  223  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 630 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  28.12 
 
 		 625 aa  223  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 629 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 687 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  29.97 
 
 		 687 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.9 
 
 		 647 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.15 
 
 		 646 aa  221  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 635 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 		 640 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 		 630 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 618 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 		 618 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 618 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 		 800 aa  220  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 618 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 628 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 		 640 aa  219  7.999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.38 
 
 		 610 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 803 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>