More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1422 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1422  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
569 aa  1158    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.38449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 
557 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  38.54 
 
 
557 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 
533 aa  353  5e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
645 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 
611 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
678 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
662 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 
664 aa  272  9e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
633 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  32.24 
 
 
637 aa  269  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 
631 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 
634 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
618 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.94 
 
 
701 aa  266  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 
588 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.89 
 
 
641 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  31.48 
 
 
631 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 
626 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
627 aa  264  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 
638 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.97 
 
 
638 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
621 aa  263  8e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 
631 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 
631 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
633 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  260  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  31.7 
 
 
633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
631 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
633 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  31.36 
 
 
634 aa  256  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 
634 aa  256  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
625 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 
637 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 
636 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 
681 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
671 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 
655 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
643 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
630 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.47 
 
 
630 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 
646 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31.45 
 
 
629 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 
645 aa  249  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.99 
 
 
631 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 
646 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.42 
 
 
646 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  31.24 
 
 
687 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.7 
 
 
647 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30 
 
 
617 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
687 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 
642 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 
686 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30 
 
 
617 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
628 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.2 
 
 
639 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 
631 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 
609 aa  246  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 
630 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 
631 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
667 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 
629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.17 
 
 
628 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
630 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 
629 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.63 
 
 
801 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 
636 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 
586 aa  243  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  30.05 
 
 
632 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
629 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 
618 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
623 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
623 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
646 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
623 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 
623 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 
625 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  29.26 
 
 
623 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
618 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
618 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 
703 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  29.79 
 
 
652 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
632 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
618 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.21 
 
 
801 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>