More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0037 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
490 aa  1000    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  42.6 
 
 
485 aa  345  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.57 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  39.6 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.32 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.65 
 
 
483 aa  306  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  40.2 
 
 
489 aa  300  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 
491 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 
493 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 
491 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  38.48 
 
 
489 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 
491 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
483 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 
480 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  37.4 
 
 
495 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.52 
 
 
490 aa  286  5e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
490 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.9 
 
 
481 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
485 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 
487 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.65 
 
 
491 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.95 
 
 
480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 
489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.45 
 
 
491 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  37.52 
 
 
491 aa  270  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 
484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  37.74 
 
 
504 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 
482 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
488 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.63 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 
501 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 
503 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 
486 aa  246  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 
481 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  34 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
486 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 
478 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 
504 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  34.26 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 
473 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  34.9 
 
 
492 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
458 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  33.91 
 
 
489 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.34 
 
 
476 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.26 
 
 
461 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
924 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
578 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
577 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
470 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.49 
 
 
972 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32 
 
 
487 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.81 
 
 
471 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  32.83 
 
 
921 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 
503 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.84 
 
 
472 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
570 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  29.96 
 
 
933 aa  176  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 
573 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
547 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.06 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
954 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 
598 aa  160  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 
597 aa  159  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 
584 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  33.59 
 
 
596 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 
672 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 
640 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 
634 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
586 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 
640 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
609 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.07 
 
 
574 aa  143  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 
610 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
615 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
612 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
612 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
619 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 
603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
582 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32.16 
 
 
641 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.54 
 
 
631 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
691 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.66 
 
 
719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  28.79 
 
 
596 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  30.02 
 
 
548 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 
610 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 
595 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
597 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.29 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.18 
 
 
647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  29.5 
 
 
669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  29.98 
 
 
711 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>