More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0578 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  90.52 
 
 		 443 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  100 
 
 		 443 aa  859    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  49.12 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  48.91 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  49.13 
 
 		 472 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  42.54 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  48.51 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  40.94 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.93 
 
 		 429 aa  282  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.12 
 
 		 924 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  43.56 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  43.56 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  43.56 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  43.86 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  42.6 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.62 
 
 		 954 aa  269  8.999999999999999e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  40.46 
 
 		 921 aa  269  8.999999999999999e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  41.6 
 
 		 933 aa  262  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  41.67 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.25 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  39.55 
 
 		 498 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.32 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  38.36 
 
 		 487 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  40.78 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  42.42 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  41.69 
 
 		 468 aa  253  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.02 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  36.59 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  39.52 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  37.99 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  35.08 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  39.84 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  37.82 
 
 		 563 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.25 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  40.9 
 
 		 496 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  42.31 
 
 		 543 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  39.91 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  36.07 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.25 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  36.48 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  39.21 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  42.4 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  35.38 
 
 		 486 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  38.46 
 
 		 519 aa  222  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  35.64 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  39.12 
 
 		 473 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  37.87 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  37.13 
 
 		 496 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  35.9 
 
 		 462 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  37.63 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  36.19 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.99 
 
 		 409 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  36.16 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  40.85 
 
 		 494 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  38 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  35.6 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.43 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  34.35 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  34.12 
 
 		 435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  36.76 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  35.08 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  40.21 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  38.21 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  39.29 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  40.36 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  34.2 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.63 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  37.86 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  36.25 
 
 		 367 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  35.67 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.63 
 
 		 368 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  30.96 
 
 		 659 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  38.35 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.07 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  38.33 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  32.01 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.23 
 
 		 972 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  34.87 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  36.75 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  36.3 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  35.21 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  36.92 
 
 		 359 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  37.94 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  35.2 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.82 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  35.28 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  35.28 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  36.68 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.36 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  34.2 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 365 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  34.2 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  34.38 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  34.04 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  38.8 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  37.23 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  32.28 
 
 		 375 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  34.94 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.51 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>