More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  100 
 
 
463 aa  889    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  55.12 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  59.82 
 
 
533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  54.32 
 
 
462 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  61.56 
 
 
457 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  54.81 
 
 
468 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  53.81 
 
 
486 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  53.86 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  54.48 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  49.78 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  53.74 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  51.72 
 
 
459 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  50.69 
 
 
460 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  49.35 
 
 
498 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  54.82 
 
 
494 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  48.92 
 
 
493 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.21 
 
 
543 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  46.94 
 
 
469 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  44.76 
 
 
517 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  47.38 
 
 
476 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  48.23 
 
 
496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  48.72 
 
 
470 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  48.72 
 
 
470 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  48.72 
 
 
470 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  53.35 
 
 
473 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  45.97 
 
 
659 aa  359  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  47.93 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  48.72 
 
 
487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  56.74 
 
 
474 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  46.3 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  46.59 
 
 
469 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  48 
 
 
487 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  46.41 
 
 
529 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  44.98 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  46.58 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  50 
 
 
470 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  45.11 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 
924 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  42.27 
 
 
480 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  43.6 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  41.84 
 
 
933 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 
954 aa  256  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  43.12 
 
 
481 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  44.76 
 
 
921 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  37.47 
 
 
426 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.01 
 
 
435 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.86 
 
 
439 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  36.36 
 
 
472 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  38.15 
 
 
472 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  35 
 
 
441 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  34.43 
 
 
463 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.1 
 
 
480 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  41.63 
 
 
444 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  37.33 
 
 
443 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  38.37 
 
 
443 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  35.7 
 
 
405 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  33.11 
 
 
422 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  34.55 
 
 
428 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  34.34 
 
 
409 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  31.95 
 
 
422 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.01 
 
 
414 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  31.81 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.24 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.33 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.87 
 
 
972 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  31.33 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  31.65 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.36 
 
 
367 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.82 
 
 
371 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 
380 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  32.88 
 
 
359 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  33.99 
 
 
423 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  30.91 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.03 
 
 
364 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  34.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  28.1 
 
 
389 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2862  cell cycle protein, FtsW  36.36 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00502116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  34.23 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  29.49 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  35.01 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  31.61 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  31.61 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  33.24 
 
 
363 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  31.78 
 
 
375 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  29.17 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1020  stage V sporulation protein E  34.72 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  30.79 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  34.22 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.43 
 
 
363 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1892  stage V sporulation protein E  34.39 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  29.64 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>