More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0339 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  100 
 
 		 409 aa  809    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  97.31 
 
 		 409 aa  731    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  48.35 
 
 		 399 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  38.42 
 
 		 414 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  39.18 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.86 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  36.34 
 
 		 498 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  37.75 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  35.83 
 
 		 459 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  37.33 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  38.03 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  37.4 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  35.9 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  32.27 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  34.38 
 
 		 470 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  35.4 
 
 		 476 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 		 924 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  35.49 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  35.58 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  33.93 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  33.93 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  33.93 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 954 aa  219  6e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  38.42 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  34.11 
 
 		 470 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  37.94 
 
 		 921 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  37.99 
 
 		 463 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  33.68 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  38.29 
 
 		 933 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  35.21 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  35.11 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  36.58 
 
 		 563 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  34.66 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  33.96 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  35.81 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  33 
 
 		 474 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  34.07 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  34.34 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.05 
 
 		 972 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  34.45 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  35.08 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  34.4 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  34.99 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  34.79 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  33.07 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  35.37 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  34.97 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  33.41 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  33.69 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  33.67 
 
 		 543 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  32.41 
 
 		 496 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  34.17 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  31.01 
 
 		 529 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  29.01 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  32.39 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  35.22 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  33.33 
 
 		 519 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  32.55 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  33.07 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.97 
 
 		 493 aa  169  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  34.58 
 
 		 441 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  34.47 
 
 		 374 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.42 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.76 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  33.25 
 
 		 371 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  33.95 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  33.64 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  31.79 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  35.89 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.21 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  32.72 
 
 		 530 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  36.23 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  31.59 
 
 		 659 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  36.13 
 
 		 367 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.59 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.32 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.5 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  29.33 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  31.21 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.58 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.82 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  31.46 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  34.47 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.82 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  31.46 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  31.46 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  33.45 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  32.36 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  29.12 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  32.78 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3512  cell division protein FtsW  35.07 
 
 		 480 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  33.23 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  31.12 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1892  stage V sporulation protein E  37.23 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.6 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  32.07 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1009  cell division protein FtsW  33.53 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172249  normal  0.019811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  33.42 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1406  cell division protein FtsW  34.5 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  0.0641122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  33.09 
 
 		 424 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>