More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4433 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  100 
 
 		 498 aa  969    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  82.69 
 
 		 493 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  52.36 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  53.96 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  52.16 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  53.71 
 
 		 533 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  51.47 
 
 		 517 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  50.64 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  51.6 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  50.64 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  53.5 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  50.64 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  49.78 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  50.53 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  52.88 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  52.14 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  56.27 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.21 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  53.19 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  50 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  50.57 
 
 		 529 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  51.44 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  45.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  51.19 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  49.89 
 
 		 563 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  45.84 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  50.22 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  50.65 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  50.61 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  49.66 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  45.59 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  49.55 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  55.05 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  45.04 
 
 		 519 aa  350  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  43.32 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.79 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  49.64 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  46.11 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 		 924 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.85 
 
 		 954 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  42.93 
 
 		 921 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  42.09 
 
 		 933 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  41.6 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.92 
 
 		 435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  40.98 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.26 
 
 		 439 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  41.63 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.05 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  40.94 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  38.69 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  39.22 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  38.98 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  39.37 
 
 		 443 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  38.11 
 
 		 409 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  38.54 
 
 		 472 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.85 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.61 
 
 		 428 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.86 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  35.25 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  37.88 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  35.81 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  34.86 
 
 		 399 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  30.26 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  35.6 
 
 		 375 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.45 
 
 		 368 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.89 
 
 		 367 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.18 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  32.18 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.68 
 
 		 359 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.38 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  31.93 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  34.23 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.59 
 
 		 972 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4569  cell division protein FtsW  34.36 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.73 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.47 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  33.65 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  33.16 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  33.67 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  32.82 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  33.5 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  32.39 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  32.39 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  32.39 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  31.79 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  32.66 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.03 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.68 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.67 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  32.13 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  32.13 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  33.67 
 
 		 413 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  33.67 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2552  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  33.23 
 
 		 391 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  33.23 
 
 		 391 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3231  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0473  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>