More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0023 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  100 
 
 
429 aa  836    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  47.95 
 
 
426 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  46.21 
 
 
493 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  45.14 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  42.11 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  46.11 
 
 
498 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  42.55 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  43.26 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  43.26 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  43.26 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  44.36 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.46 
 
 
954 aa  298  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.82 
 
 
924 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  42.79 
 
 
459 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  46.48 
 
 
487 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  43.94 
 
 
435 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  42.34 
 
 
460 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  43.67 
 
 
439 aa  289  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  42.54 
 
 
459 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.86 
 
 
517 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  43.32 
 
 
533 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  41.04 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  43.15 
 
 
921 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  44.29 
 
 
933 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  43.97 
 
 
457 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  40.97 
 
 
496 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  43.34 
 
 
441 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  43.04 
 
 
563 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  40.79 
 
 
472 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  40.69 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  43.73 
 
 
475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  41.29 
 
 
462 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  40.11 
 
 
486 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  39.47 
 
 
414 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  43.6 
 
 
463 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  42.42 
 
 
473 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  40.21 
 
 
469 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  42.64 
 
 
487 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  39.12 
 
 
496 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  41.1 
 
 
543 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  44 
 
 
480 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  42.49 
 
 
472 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  41.18 
 
 
493 aa  260  4e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  40.84 
 
 
443 aa  259  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  41.32 
 
 
405 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  41.93 
 
 
443 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  41.04 
 
 
399 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  38.04 
 
 
529 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.79 
 
 
463 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  37.03 
 
 
422 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  39.54 
 
 
463 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  37.62 
 
 
519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  35.15 
 
 
517 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  40.1 
 
 
474 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  40.93 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  40.9 
 
 
444 aa  234  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  36.92 
 
 
659 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  35.96 
 
 
422 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.85 
 
 
428 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  38.03 
 
 
409 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  37.5 
 
 
409 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  39.56 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  38.21 
 
 
480 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  35.68 
 
 
367 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  32.35 
 
 
374 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.19 
 
 
371 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  35.11 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.52 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  36.19 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  33.51 
 
 
423 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.52 
 
 
368 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.96 
 
 
375 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 
380 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  33.24 
 
 
365 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.72 
 
 
367 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  32.53 
 
 
365 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  35.06 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  36.53 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.97 
 
 
972 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.94 
 
 
354 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.61 
 
 
363 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.61 
 
 
420 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  32.89 
 
 
369 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  33.16 
 
 
467 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  36.93 
 
 
359 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  33.7 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.93 
 
 
374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  31.93 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  33.16 
 
 
509 aa  162  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  31.62 
 
 
370 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1494  cell cycle protein  34.93 
 
 
382 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00473768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>