More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0030 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  100 
 
 
475 aa  927    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  62.75 
 
 
470 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  61.47 
 
 
476 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  60.87 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  60.87 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  60.87 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  58.61 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  62.09 
 
 
470 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  55.82 
 
 
543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  52.89 
 
 
487 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  49.89 
 
 
493 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  53.76 
 
 
459 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  49.46 
 
 
468 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  51.05 
 
 
487 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  50.44 
 
 
498 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  52.32 
 
 
473 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  46.14 
 
 
496 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  48.66 
 
 
460 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  45.73 
 
 
496 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.91 
 
 
517 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  49.32 
 
 
533 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  47.48 
 
 
459 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  46.26 
 
 
563 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.11 
 
 
463 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  44.39 
 
 
486 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  45.67 
 
 
462 aa  346  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  43.46 
 
 
529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  44.8 
 
 
457 aa  339  8e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  46.03 
 
 
496 aa  336  7e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  43.35 
 
 
659 aa  336  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  43.09 
 
 
469 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  49.11 
 
 
474 aa  332  9e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  48.66 
 
 
494 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  43.99 
 
 
429 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  38.1 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  42.67 
 
 
463 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  41.26 
 
 
519 aa  299  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  40.89 
 
 
493 aa  293  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  40.92 
 
 
426 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 
924 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 
954 aa  264  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  41.69 
 
 
441 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  40.62 
 
 
435 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  40.58 
 
 
933 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  38.9 
 
 
443 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  38.82 
 
 
921 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  43.86 
 
 
439 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  44.61 
 
 
481 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  40.6 
 
 
480 aa  246  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.43 
 
 
422 aa  246  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  38.82 
 
 
405 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  39.49 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.92 
 
 
414 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  39.19 
 
 
472 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  39.75 
 
 
472 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  36.99 
 
 
443 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  35.08 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  37.81 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  35.08 
 
 
409 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  36.22 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  35.41 
 
 
399 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.26 
 
 
422 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  34.77 
 
 
463 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  34.66 
 
 
420 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  38.34 
 
 
972 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.48 
 
 
423 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.33 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  34.03 
 
 
368 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  34.57 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  34.57 
 
 
375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  38.23 
 
 
391 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3512  cell division protein FtsW  31.47 
 
 
480 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  30.61 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.99 
 
 
380 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.23 
 
 
367 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  34.49 
 
 
374 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  33.59 
 
 
395 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3963  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  39.79 
 
 
368 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  30.69 
 
 
359 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3691  cell cycle protein FtsW  39.79 
 
 
393 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3708  cell cycle protein FtsW  39.79 
 
 
393 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000336622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  30.71 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  30.54 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  35 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  30.05 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  33.56 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
371 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4012  cell cycle protein  30.73 
 
 
427 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  32.72 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  30.69 
 
 
369 aa  146  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  29.76 
 
 
365 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  30.47 
 
 
509 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4158  cell cycle protein FtsW  39.31 
 
 
369 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  30.93 
 
 
396 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3860  cell cycle protein FtsW  39.31 
 
 
394 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.24 
 
 
374 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  32.06 
 
 
412 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>