More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0025 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  100 
 
 		 468 aa  913    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  58.47 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  54.51 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  52.75 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  52.53 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  56.46 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  52.26 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  52.36 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  52.63 
 
 		 563 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  57.11 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  57.8 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  54.81 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  53.2 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  47.23 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  48.91 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  50.11 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  55.02 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  48.12 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  52.75 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  50.32 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  51.03 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  52.1 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  50.33 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.55 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  49.3 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  49.3 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  49.3 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  49.24 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  49.24 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  48.79 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  45.21 
 
 		 659 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  49.43 
 
 		 543 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  49.34 
 
 		 487 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  53.39 
 
 		 474 aa  352  8.999999999999999e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  45.72 
 
 		 529 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  45.39 
 
 		 519 aa  343  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  48.18 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  42.55 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.34 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  42.41 
 
 		 480 aa  289  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  42.98 
 
 		 933 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  45.85 
 
 		 481 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 		 924 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  40.21 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.81 
 
 		 954 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  41.45 
 
 		 921 aa  259  7e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  40.81 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.05 
 
 		 439 aa  246  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  38.83 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  43.65 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  37.01 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  40.9 
 
 		 443 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  35.64 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  34.9 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  40.42 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  36.99 
 
 		 463 aa  222  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  34.11 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  38.4 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  38.02 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.61 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  35.6 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  34.74 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.03 
 
 		 414 aa  203  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  30.63 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  30.63 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.58 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  35.46 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.51 
 
 		 972 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.45 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  34.52 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  30.41 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  29.69 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.54 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  29.71 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  28.65 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.77 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  33.14 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  31.34 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  28.92 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  31.42 
 
 		 354 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  30.75 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  31.1 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3995  cell cycle protein FtsW  30.75 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  30.77 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.89 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.42 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  31.43 
 
 		 375 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  28.77 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  31.23 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  32.89 
 
 		 363 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  31.09 
 
 		 427 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1189  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  29.92 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1634  cell cycle protein  29.27 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  28.95 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  30.71 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3774  cell cycle protein  33.23 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  28.06 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  30.71 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>