More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0033 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  100 
 
 		 493 aa  992    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  65.04 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  52.99 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  49.12 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  44.27 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  46.56 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  44.1 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  48.18 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  43.32 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  51.77 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  44.66 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  51.17 
 
 		 457 aa  348  9e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  46.79 
 
 		 486 aa  346  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  44.04 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  46.51 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.73 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  44.58 
 
 		 462 aa  339  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.09 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  40.98 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  48.02 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  43.22 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  40.28 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  45.67 
 
 		 459 aa  312  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  44.85 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  44.85 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  44.85 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  44.83 
 
 		 473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  46.73 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  38.96 
 
 		 659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  47.15 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  44.06 
 
 		 469 aa  299  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  43.29 
 
 		 487 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  40.9 
 
 		 496 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  41.96 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  43.9 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.18 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  40.85 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  40.67 
 
 		 475 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  35.97 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  40.2 
 
 		 921 aa  243  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 		 924 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  38.78 
 
 		 933 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  39.86 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  37.19 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.29 
 
 		 954 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  37.92 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  39.57 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  38.96 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  37.44 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  35.39 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  32.65 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  35.84 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  35.64 
 
 		 443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  38.33 
 
 		 480 aa  213  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  33.93 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  31.14 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  34.76 
 
 		 472 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  37 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  33.77 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.43 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  31.97 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  31.34 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.01 
 
 		 972 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  30.87 
 
 		 409 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  31.46 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  30.73 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.94 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.94 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 387 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  30.48 
 
 		 370 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  29.23 
 
 		 365 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  31.41 
 
 		 365 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.34 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  28.62 
 
 		 368 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  27.97 
 
 		 368 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  28.8 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  29.94 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0658  cell cycle protein  29.11 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  30 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  30.66 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  31.02 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2635  cell cycle protein  32.57 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  29.3 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  31.29 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  29.74 
 
 		 412 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  31.86 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  31.37 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  29.79 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  29.48 
 
 		 375 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  28.92 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  30.64 
 
 		 506 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  29.16 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  32.92 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1127  cell cycle protein  30.69 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  27.79 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  28.99 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1009  cell division protein FtsW  29.69 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172249  normal  0.019811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  32.3 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  32.92 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>