More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1802 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  100 
 
 		 636 aa  1301    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 636 aa  1301    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  41.44 
 
 		 602 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  41.44 
 
 		 602 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.44 
 
 		 645 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  41.23 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.22 
 
 		 646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  38.79 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 636 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  38.79 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.11 
 
 		 629 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.83 
 
 		 629 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  38.95 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 		 646 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 618 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  40 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 		 617 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  36.83 
 
 		 638 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  37.39 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  35.32 
 
 		 638 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  34.42 
 
 		 637 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  38.24 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  38.71 
 
 		 631 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  38.23 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 612 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 		 640 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  38.15 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  38.01 
 
 		 626 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.15 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  36.29 
 
 		 625 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  37.4 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 		 703 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.55 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 767 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 		 632 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  38.09 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 618 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 618 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 		 618 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  39.27 
 
 		 681 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.76 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 627 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 765 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 765 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 760 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.43 
 
 		 761 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 		 610 aa  362  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 618 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 756 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  35.09 
 
 		 775 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 764 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 618 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 		 803 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  35.62 
 
 		 809 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.64 
 
 		 801 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35 
 
 		 646 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  35.94 
 
 		 634 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 		 800 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  35.94 
 
 		 634 aa  359  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  37.58 
 
 		 655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 		 662 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  36.19 
 
 		 631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.2 
 
 		 630 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.19 
 
 		 679 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  37.46 
 
 		 626 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  36.51 
 
 		 634 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 		 683 aa  356  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  35.16 
 
 		 632 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 		 691 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 793 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.25 
 
 		 637 aa  353  5e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>