More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5853 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  100 
 
 		 306 aa  594  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  66.03 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  71.04 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  59.05 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  58.63 
 
 		 313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  59.93 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.96 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  60.2 
 
 		 349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  58.92 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  62.29 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  58.69 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  58.41 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  55.95 
 
 		 320 aa  308  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  52.94 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  55.67 
 
 		 301 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  53.29 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  55.56 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  50.61 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  53.07 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  49.5 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  57.43 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  59.03 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  52.63 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.88 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  50.65 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  50.65 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  51.11 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  50.32 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  50.47 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  50.65 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 920 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 920 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 929 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 904 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  44.11 
 
 		 893 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 949 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 909 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 906 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 917 aa  178  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 908 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 875 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  37.38 
 
 		 901 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 886 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 885 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 901 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 945 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 905 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 878 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 911 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 902 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 895 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  32.11 
 
 		 890 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 894 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  46.72 
 
 		 910 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 912 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  42.39 
 
 		 899 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 896 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 884 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  42.36 
 
 		 899 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  39.65 
 
 		 1025 aa  162  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  41.04 
 
 		 482 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  40.3 
 
 		 484 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.64 
 
 		 940 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 872 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  30.79 
 
 		 894 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 891 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 905 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 901 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.55 
 
 		 870 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 888 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  40 
 
 		 929 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.32 
 
 		 843 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 957 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 955 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 868 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 908 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 899 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 899 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 892 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 889 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 904 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 908 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 883 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  28.2 
 
 		 898 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 928 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 888 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 955 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  31.69 
 
 		 885 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 893 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  29.18 
 
 		 877 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  29.51 
 
 		 877 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.96 
 
 		 933 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 988 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  29.69 
 
 		 850 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 893 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 896 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  29.18 
 
 		 891 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  31.15 
 
 		 876 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>