More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3511 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 319 aa  610  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  71.7 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  66.13 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  59.05 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  61.46 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  58.28 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  56.88 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  57.05 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  55.77 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  58.15 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  53 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  58.84 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  54.52 
 
 		 301 aa  298  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  52.94 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  53.46 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.79 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  56.6 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  50.31 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  49.37 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  49.37 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  49.37 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  48.22 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  47.71 
 
 		 347 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  48.9 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  46.77 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  47.6 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  50.16 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  54.26 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 893 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 917 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 920 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 920 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 929 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 901 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 906 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  34.94 
 
 		 908 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 909 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 949 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 870 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 945 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 875 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  35.26 
 
 		 904 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 885 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 905 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 955 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  33.11 
 
 		 1025 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 894 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  34.82 
 
 		 911 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 888 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  35.42 
 
 		 878 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 886 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37 
 
 		 868 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.99 
 
 		 895 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 910 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  33 
 
 		 955 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 884 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 891 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 910 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  32.59 
 
 		 901 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 944 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 480 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  30.36 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 899 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  30.36 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  30.36 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  30.36 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  31.39 
 
 		 945 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 912 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  30.03 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 904 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  31.8 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  28.76 
 
 		 880 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  30.03 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 866 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 850 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 901 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 977 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  31.17 
 
 		 876 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 885 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  29.7 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  30.94 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  29.24 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 866 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 905 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  29.7 
 
 		 288 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  29.7 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3602  5'-3' exonuclease  35.31 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.96 
 
 		 888 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.55 
 
 		 878 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  36.88 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 928 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 899 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 899 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 902 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  32.78 
 
 		 894 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 908 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 892 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>