More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3173 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 303 aa  603  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  52.67 
 
 		 315 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  50.67 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  49.83 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  50.16 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  46.56 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  51.67 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  48.41 
 
 		 393 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  48.88 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  47.44 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.18 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  46.77 
 
 		 319 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  45.07 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  46.49 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  46.98 
 
 		 326 aa  254  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  45.95 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  44.05 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  44.52 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  45 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  44.52 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  44.52 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  49.18 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  44.97 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  45.39 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  43.67 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  45.13 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  47.06 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  44.16 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  44.77 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  46.95 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 929 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 920 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 920 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 949 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 902 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 904 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 905 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 908 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 909 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 899 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 901 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 875 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  34.45 
 
 		 884 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  42.73 
 
 		 910 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 890 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 843 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 917 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 893 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 912 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 911 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 915 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 895 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  37.44 
 
 		 888 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 885 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 906 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  32.35 
 
 		 894 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  32.36 
 
 		 972 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  32.36 
 
 		 972 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 945 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.36 
 
 		 886 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  27.7 
 
 		 872 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 901 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  37.27 
 
 		 901 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 908 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.7 
 
 		 930 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  34.58 
 
 		 893 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 955 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 956 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 988 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  35.39 
 
 		 905 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 908 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 878 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 929 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 943 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 893 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  31.92 
 
 		 937 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 933 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 868 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 910 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  34.25 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 902 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 870 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 940 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  28.52 
 
 		 898 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 904 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  31.49 
 
 		 891 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 893 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3602  5'-3' exonuclease  34.62 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  33.07 
 
 		 924 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  33.46 
 
 		 953 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  31.48 
 
 		 924 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 979 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  29.82 
 
 		 912 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  34.82 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  30.69 
 
 		 910 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  34.24 
 
 		 1033 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  31.99 
 
 		 893 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  34.8 
 
 		 976 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>