More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0949 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  82.64 
 
 		 484 aa  805    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  70.95 
 
 		 474 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  73.24 
 
 		 480 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  75.46 
 
 		 474 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  100 
 
 		 482 aa  968    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  53.87 
 
 		 891 aa  306  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  52.65 
 
 		 893 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  51.86 
 
 		 892 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  51.55 
 
 		 892 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  51.19 
 
 		 892 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  50.86 
 
 		 892 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 891 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  53.28 
 
 		 888 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  47.67 
 
 		 870 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  47.86 
 
 		 924 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  43.75 
 
 		 979 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  44.1 
 
 		 976 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  43.4 
 
 		 978 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  46.79 
 
 		 1020 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 911 aa  243  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1014 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  46.07 
 
 		 1032 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  45.55 
 
 		 979 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1010 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  45.36 
 
 		 1033 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 968 aa  238  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1025 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 892 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  45.67 
 
 		 924 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  44.64 
 
 		 1021 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 992 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  45.29 
 
 		 884 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  43.39 
 
 		 897 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  43.77 
 
 		 885 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  45.68 
 
 		 902 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  43.05 
 
 		 897 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 937 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 978 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  42.35 
 
 		 928 aa  227  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 895 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 897 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 872 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  43.96 
 
 		 902 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 866 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  42.37 
 
 		 899 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 878 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  43.37 
 
 		 973 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  43.59 
 
 		 902 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.16 
 
 		 906 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  42.37 
 
 		 937 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  42.37 
 
 		 937 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 876 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  44.77 
 
 		 928 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 1004 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  43.42 
 
 		 903 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  42.96 
 
 		 933 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 932 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 932 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  44.57 
 
 		 943 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 932 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 931 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 930 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 935 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 866 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 866 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 928 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  42.45 
 
 		 934 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 945 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 928 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  44.27 
 
 		 941 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 930 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 912 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  42.14 
 
 		 929 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  46.43 
 
 		 912 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  43.66 
 
 		 945 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  42.14 
 
 		 940 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  45.95 
 
 		 904 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 877 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 877 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  43.05 
 
 		 911 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 877 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44.79 
 
 		 878 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>