More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2864 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  76.03 
 
 		 484 aa  757    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  100 
 
 		 480 aa  981    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  70.21 
 
 		 474 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  71.88 
 
 		 474 aa  693    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  72.93 
 
 		 482 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  53.87 
 
 		 891 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  53.98 
 
 		 891 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  54.29 
 
 		 893 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  52.07 
 
 		 892 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  54.29 
 
 		 892 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  53.21 
 
 		 892 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  51.72 
 
 		 892 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  53.65 
 
 		 888 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  47.86 
 
 		 924 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  46.95 
 
 		 870 aa  259  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  46.81 
 
 		 1020 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  45.82 
 
 		 911 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1014 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1032 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 1033 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  45.36 
 
 		 1021 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  45.36 
 
 		 1025 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  45.36 
 
 		 979 aa  246  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  43.4 
 
 		 992 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  45 
 
 		 1010 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  44.22 
 
 		 937 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 937 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 937 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  47.35 
 
 		 895 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  45.61 
 
 		 924 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 979 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  43.06 
 
 		 976 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  42.36 
 
 		 978 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.88 
 
 		 906 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 892 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  44.77 
 
 		 884 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  45.09 
 
 		 943 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  44.61 
 
 		 888 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 968 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 928 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  46.43 
 
 		 941 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 929 aa  233  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  44.4 
 
 		 903 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  42.76 
 
 		 897 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 897 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  42.4 
 
 		 973 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  45.65 
 
 		 866 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 872 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  44.2 
 
 		 902 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  41.45 
 
 		 299 aa  229  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  44 
 
 		 902 aa  229  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  43.62 
 
 		 903 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 978 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 897 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 1004 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  43.84 
 
 		 902 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.81 
 
 		 885 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 935 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  45.62 
 
 		 912 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  46.49 
 
 		 899 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  46.49 
 
 		 899 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  42.65 
 
 		 932 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 928 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  39.78 
 
 		 877 aa  224  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.12 
 
 		 916 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 932 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 932 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 932 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  42.05 
 
 		 934 aa  223  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 899 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  43.17 
 
 		 930 aa  223  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 930 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 877 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  42.91 
 
 		 928 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  41.99 
 
 		 938 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 891 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 891 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 891 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 939 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 877 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 877 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 877 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 923 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 878 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  43.01 
 
 		 934 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  40 
 
 		 866 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 876 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 877 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 999 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 928 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 1016 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 877 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>