More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3097 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 321 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  83.28 
 
 		 323 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  76.51 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  76.19 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  76.19 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  73.33 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.63 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  60.26 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  58.15 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  55.35 
 
 		 349 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  51.44 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  51.59 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  51.27 
 
 		 353 aa  278  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  47.15 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  50.47 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  51.3 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.11 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  51.95 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  50.63 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  47.32 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  47.92 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  50.8 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  45.95 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  45.83 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  47.59 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  44.9 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  46.13 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  47.15 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  40.8 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 906 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 949 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 875 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 917 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 892 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 891 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 893 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 929 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 908 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 909 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 920 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 920 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 904 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 870 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 929 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 893 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 904 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 945 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 902 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  31.91 
 
 		 878 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 911 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 901 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  31.65 
 
 		 944 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  36.89 
 
 		 912 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 902 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 872 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 928 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 892 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 899 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 888 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  34.68 
 
 		 899 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.31 
 
 		 888 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 895 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.07 
 
 		 878 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 908 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  36.02 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 894 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  30.89 
 
 		 902 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  32.03 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  32.03 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.73 
 
 		 484 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 892 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  32.76 
 
 		 905 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 910 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 888 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 885 aa  132  9e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  29.63 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 886 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.89 
 
 		 933 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  31.86 
 
 		 876 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 918 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  35.83 
 
 		 901 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 891 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 911 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  29.81 
 
 		 898 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  38.43 
 
 		 910 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 912 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 892 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 932 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 932 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 932 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  35.64 
 
 		 482 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  34.92 
 
 		 889 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  30.1 
 
 		 877 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  37.07 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 937 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 901 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 904 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  33.48 
 
 		 885 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 480 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>