More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2173 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  60.31 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  59.03 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  59.42 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  58.41 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  58.15 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  56.96 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  56.63 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  56.63 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  53.73 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  47.75 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  50.65 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  51.3 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  49.84 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  54.9 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  49.52 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  51.92 
 
 		 353 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  47.3 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  47.6 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  47.24 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  46.62 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  46.65 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  46.62 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  48.38 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  45.13 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  46.45 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  46.3 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  47.65 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  45.62 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  44.87 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 949 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 920 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 920 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 929 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  42.26 
 
 		 909 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 904 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  43.1 
 
 		 908 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 917 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 893 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 901 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.96 
 
 		 905 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 905 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 904 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.35 
 
 		 875 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 906 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  38.02 
 
 		 902 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 945 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 911 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33.54 
 
 		 901 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.93 
 
 		 872 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  38.56 
 
 		 901 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 912 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 891 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  32.92 
 
 		 908 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  32.48 
 
 		 893 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 886 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  29.97 
 
 		 878 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 888 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 480 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 894 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 928 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 870 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 878 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 910 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 880 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 904 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  33.78 
 
 		 892 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 933 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 899 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 890 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 891 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 888 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 910 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 876 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 843 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 895 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  34.89 
 
 		 945 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 868 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  32.15 
 
 		 912 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  30 
 
 		 866 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 955 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 929 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 885 aa  126  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 892 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  38.14 
 
 		 484 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  37.72 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  29.89 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 955 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  31.1 
 
 		 876 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  31.11 
 
 		 922 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  33.89 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 922 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 922 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  34.5 
 
 		 899 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 892 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  30.69 
 
 		 888 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  34.19 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  31.99 
 
 		 934 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 878 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 922 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>