More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2515 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  99.68 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  99.68 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  76.51 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  74.61 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  74.05 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  62.81 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  58.65 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  56.69 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  56.96 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  52.38 
 
 		 313 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  48.36 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  49.37 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  51.11 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  50.32 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  50.32 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  50.48 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  47.48 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  48.08 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  51.14 
 
 		 301 aa  261  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  48.1 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  52.14 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  44.52 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  45.02 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  50 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  45.48 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  47.28 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  44.01 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  42.4 
 
 		 906 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 949 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 909 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 920 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 929 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 920 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 893 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 904 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 908 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 917 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.19 
 
 		 870 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 902 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 901 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 901 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 891 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 912 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 905 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 892 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 875 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 911 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 929 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 904 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  39.68 
 
 		 945 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 892 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 888 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 905 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 894 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 893 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  31.83 
 
 		 877 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  30.48 
 
 		 872 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.76 
 
 		 885 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 892 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  34.42 
 
 		 945 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 933 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 		 1025 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 878 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 877 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 877 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  38 
 
 		 901 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 899 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 955 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 892 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 891 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 891 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 891 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 912 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 877 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.73 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 877 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  30.87 
 
 		 877 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 895 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 877 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 944 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 908 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  31.19 
 
 		 877 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  34.72 
 
 		 955 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 910 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  35.54 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 891 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  36.36 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 908 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 889 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 843 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 876 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 912 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 930 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  32.86 
 
 		 992 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>