More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5859 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.72 
 
 
912 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  35.29 
 
 
949 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  38.58 
 
 
910 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  36.61 
 
 
904 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.11 
 
 
920 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.11 
 
 
920 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.91 
 
 
908 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.11 
 
 
929 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.5 
 
 
905 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  40.51 
 
 
315 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  40 
 
 
353 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  34.87 
 
 
917 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.16 
 
 
909 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  41.13 
 
 
320 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.8 
 
 
884 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.5 
 
 
901 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.28 
 
 
910 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.55 
 
 
902 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 
901 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  36.32 
 
 
899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  39.6 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  35.39 
 
 
893 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  35 
 
 
893 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  34.02 
 
 
878 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  36.09 
 
 
904 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  37.31 
 
 
323 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.04 
 
 
899 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  38.96 
 
 
306 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  35.19 
 
 
316 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  35.19 
 
 
316 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  35.54 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  33.46 
 
 
875 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  34.51 
 
 
912 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  33.73 
 
 
878 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  34.12 
 
 
911 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  36.6 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  33.96 
 
 
908 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.77 
 
 
888 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  34.49 
 
 
393 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.33 
 
 
912 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  33.47 
 
 
894 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.48 
 
 
885 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  31.92 
 
 
850 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  35.94 
 
 
926 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.68 
 
 
878 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.85 
 
 
895 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  35.09 
 
 
933 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  34.89 
 
 
889 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  33.21 
 
 
876 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  33.33 
 
 
930 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  38.08 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  36.02 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  32.55 
 
 
868 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  35.22 
 
 
906 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.03 
 
 
908 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  31.16 
 
 
929 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.9 
 
 
843 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  30.4 
 
 
888 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  34.56 
 
 
928 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37 
 
 
934 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  33.33 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  31.43 
 
 
929 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  31.8 
 
 
945 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  32.39 
 
 
891 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  31.66 
 
 
928 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  31.66 
 
 
928 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  31.66 
 
 
928 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  37.87 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  33.33 
 
 
934 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  31.66 
 
 
928 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.32 
 
 
931 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  33.33 
 
 
905 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  31.54 
 
 
932 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  33.43 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  31.54 
 
 
932 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  35.51 
 
 
872 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  34.1 
 
 
928 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  31.54 
 
 
932 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  32.14 
 
 
866 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  32.11 
 
 
911 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.79 
 
 
903 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  36.55 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  37.39 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  33.82 
 
 
904 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  33.64 
 
 
945 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  33.94 
 
 
918 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  33.94 
 
 
921 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  31.79 
 
 
866 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  32.17 
 
 
928 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  35.42 
 
 
1033 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  34.1 
 
 
930 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>