More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2659 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  57.28 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  56.11 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  55.67 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.14 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  55.78 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  56.54 
 
 		 315 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  54.52 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  56.45 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  54.07 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  55.37 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.41 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  52.75 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  51.38 
 
 		 333 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.95 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  51.14 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  51.14 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  51.14 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  50.64 
 
 		 323 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  52.66 
 
 		 347 aa  258  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  52.26 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  52.32 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  51.8 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  52.24 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  46.49 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  53.11 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.38 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  50.17 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  44.25 
 
 		 920 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  46.02 
 
 		 904 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  44.25 
 
 		 920 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 949 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  44.25 
 
 		 929 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 909 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 908 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 917 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 888 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 901 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 911 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 905 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 893 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 899 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 899 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 884 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 905 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 902 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 908 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 912 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  41.07 
 
 		 895 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 906 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  34.05 
 
 		 893 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  30.64 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 945 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 901 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 910 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 904 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 876 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  33.21 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.79 
 
 		 888 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 878 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 		 901 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  28.08 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  29.26 
 
 		 898 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 933 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 870 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 910 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 480 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  34.15 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 908 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 929 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 886 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  32 
 
 		 940 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.89 
 
 		 951 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  32.13 
 
 		 891 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  31.77 
 
 		 912 aa  135  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  30 
 
 		 896 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  32.16 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  29.33 
 
 		 896 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 911 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.77 
 
 		 872 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  34.46 
 
 		 955 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  30.07 
 
 		 877 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  31.11 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  32.55 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  32.16 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 930 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  32.16 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  32.16 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  32.16 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 915 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  32.16 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  30.36 
 
 		 866 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 876 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 866 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  30.36 
 
 		 866 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  33.8 
 
 		 484 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>